prikaz prve stranice dokumenta Geografska raspodjela genetske varijabilnosti populacije svinja banijske šare
Access restricted to students and staff of home institution
master's thesis
Geografska raspodjela genetske varijabilnosti populacije svinja banijske šare
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Agriculture, 2019. urn:nbn:hr:204:790757
Čuklić, Nina
University of Zagreb
Faculty of Agriculture
Animal Science

Institutional repository: Repository Faculty of Agriculture University of Zagreb

Cite this document

Čuklić, N. (2019). Geografska raspodjela genetske varijabilnosti populacije svinja banijske šare (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Agriculture. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:790757

Čuklić, Nina. "Geografska raspodjela genetske varijabilnosti populacije svinja banijske šare." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Agriculture, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:790757

Čuklić, Nina. "Geografska raspodjela genetske varijabilnosti populacije svinja banijske šare." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Agriculture, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:790757

Čuklić, N. (2019). 'Geografska raspodjela genetske varijabilnosti populacije svinja banijske šare', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Agriculture, accessed 21 December 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:790757

Čuklić N. Geografska raspodjela genetske varijabilnosti populacije svinja banijske šare [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Agriculture; 2019 [cited 2024 December 21] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:790757

N. Čuklić, "Geografska raspodjela genetske varijabilnosti populacije svinja banijske šare", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Agriculture, Zagreb, 2019. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:790757

Metadata
TitleGeografska raspodjela genetske varijabilnosti populacije svinja banijske šare
Title (english)Geographical distribution of genetic variability in the population of the Banija pigs
AuthorNina Čuklić
MentorDragica Šalamon (mentor)
Committee memberDragica Šalamon (predsjednik povjerenstva)
Committee memberKrešimir Salajpal (član povjerenstva)
Committee memberDanijel Karolyi (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Agriculture
(Animal Science)
Zagreb
Defense date and country2019-09-26, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		BIOTECHNICAL SCIENCES
Agronomy
Abstract
Cilj istraživanja je utvrditi čini li populacija svinje banijske šare zasebnu genetsku strukturu razlučivu od geografski i genetski bliskih populacija, pomoću multivarijatnih metoda i prostorne informacije. Prostornom analizom glavnih komponenti (sPCA), te geneland klasteriranjem obrađeni su georeferencirani mikrosatelitni genotipovi 86 jedinki četiri pasmine svinja (turopoljske, crne slavonske, banijske šare i njemačkog landrasa) u sustavu R pomoću adegenet i geneland paketa. Rezultati sPCA pokazuju: (i) da se očekivani utjecaj genotipa turopoljske svinje na banijsku šaru progresivno smanjuje u jugoistočnom smjeru; (ii) uzorci turopoljske svinje razdvajaju se od ostalih prvom globalnom osi; (iii) uzorci banijske šare grupiraju se u dvije skupine. Geneland analizom potvrđeni su rezultati sPCA i prepoznato je pet klastera te su izrađene karte. Banijska šara je razlučiva od ostalih analiziranih pasmina, te uzorci čine dvije genetske skupine.
Abstract (english)
The aim of the research was to determine if the Banija spotted pig population has genetic structure differentiated from geographically and genetically close populations, using multivariate methods in combination with the spatial GIS information. Spatial principal component analysis and Geneland clustering were used for the analysis of 86 georeferenced genotypes of four pig breeds (Turopolje, Black Slavonian, Banija spotted and German landrace) using the adegenet and geneland packages for R software. Results of sPCA show: (i) the expected genetic cline of Turopolje breed into Banija spotted pig; (ii) first global axis divides Turopolje samples from other breeds; (iii) Banija spotted samples form two groups. Geneland clustering confirmed sPCA results by recognizing five clusters shown on the maps. Banija spotted pig is genetically differentiated from the rest of analyzed genotypes and forms two groups.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:204:790757
Study programmeTitle: Animal Genetics and Breeding
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/ magistra inženjer/inženjerka genetike i oplemenjivanja životinja (magistar/ magistra inženjer/inženjerka genetike i oplemenjivanja životinja)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsAccess restricted to students and staff of home institution
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2019-11-20 12:25:39