Dušik je jedan od glavnih hranjivih sastojaka za rast i razvoj biljaka. Nedostatak dušika u tlu smanjuje prinos usjeva. Najveće količine dušika nalaze se u atmosferi, ali u obliku koji biljke ne mogu usvajati. Iako se dušik u tlu može nadomjestiti primjenom dušičnih gnojiva, danas veliki značaj u održivoj poljoprivrednoj proizvodnji ima, ekološki prihvatljiv izvor dušika, biološka fiksacija. Kroz simbiozni odnos kvržične bakterije Bradyrhizobium japonicum (mikrosimbionta) i soje (Glycine max (L.) Merrill) (makrosimbionta) moguće je fiksirati atmosferski dušik. Predsjetvenom bakterizacijom sjemena leguminoza s visoko učinkovitim sojevima kvržičnih bakterija nastoji se što više pojačati prirodni proces simbiozne fiksacije dušika. Kako bi se dobio kvalitetan inokulum velika pažnja posvećuje se selekciji visokih kompetitivnih i efikasnih sojeva koji su otporni na razne nepovoljne uvjete u tlima. Zbog navedenog, važna je izolacija i identifikacija autohtonih sojeva B. japonicum što je i glavni cilj ovoga istraživanja. Uzorci tla za izolaciju kvržičnih bakterija prikupljeni su s područja Koprivničko – križevačke, Bjelovarsko – bilogorske i Vukovarsko – srijemske županije. Istraživanjem je obuhvaćeno 18 izolata te jedan referentni soj B. japonicum. Identifikacijom izolata pomoću molekularnih metoda utvrđena je genetska varijabilnost unutar prirodnih populacija ovih bakterija tla. Rezultati 16S rDNA PCR – RFLP metode ukazuju da svi izolati pripadaju vrsti B. japonicum. Primjenom RAPD metode utvrđena je iznimno velika genetsku varijabilnost između istraživanih sojeva. Najveća genetska raznolikost utvrđena je između sojeva izoliranih s područja Vukovarsko – srijemske županije, a najmanja s područja Koprivničko – križevačke županije.