Matrična organizacijska struktura predstavlja logičan odabir u organizacijama koje traže bržu promjenu u poslovanju nastalu kao rezultat unutarnje potrebe ili pak izazvanu utjecajem izvana. Proces oblikovanja i implementacije matrične strukture je puno duži od same odluke o promjeni organizacijske strukture. U tom procesu se menadžment i zaposlenici susreću s nizom izazova koje je važno prepoznavati i sustavno djelovati na njihovom rješavanju. Dok struktura organizaciji daje oblik, sadržaj joj daju jasna strategija, ljudi, procesi i sustav nagrađivanja, a s kojima se utječe na ponašanje pojedinaca, efikasnost izvedbe i organizacijsku kulturu u cjelini. Uspješna matrična organizacija je ona koja je uspjela prevladati izazove implementacije, nastavila razvijati kompetencije zaposlenika i menadžera za rad u istoj uz istovremenu efikasniju isporuku rezultata. U radu su analizirane specifičnosti oblikovanja i implementacije matrične organizacijske strukture u bankovnom sektoru, pri čemu su utvrđeni razlozi zbog kojih se matrična organizacijska struktura uvodi u banke. Provedbom anketnog upitnika ispitani su izazovi u implementiranju matrične organizacijske strukture s kojima se susreću menadžment i zaposlenici banke, te su predložena moguća poboljšanja koja će utjecati na kvalitetniju implementaciju matrične strukture i povećanje efikasnosti poslovanja matrične organizacije banke. Utvrđeno je da banke posežu za matričnom organizacijskom strukturom kako bi provele važne promjene u kratkom roku, te da je proces implementacije matrične organizacijske strukture u bankama na hrvatskom tržištu složeniji i izazovniji zbog činjenice da se banke većinom nalaze u stranom vlasništvu pri čemu se matična banka nalazi u inozemstvu, a banka kćer djeluje kao matrica u matrici. Provedenim istraživanjem je utvrđeno da je top menadžment počeo provoditi promjene pozitivno vrednovane od menadžera i zaposlenika, ali se matrična organizacija banke još bori s izazovima nedostatne komunikacije, konfliktima, nerazumijevanjem vlastite uloge i odgovornosti zaposlenika, te nedostatkom timskog rada. Stoga se nakon provedenog istraživanja došlo da zaključka da se uočene slabosti mogu ublažiti kroz adekvatan sustav treninga kojim će menadžeri i zaposlenici razviti vještine potrebne za rad u matričnoj organizaciji. Posjedovanje istih umanjit će otpor prema promjeni, poboljšati komunikaciju, smanjiti konflikte, pojačati timski rad, povećati razumijevanje vlastite uloge u organizaciji, povećati zadovoljstvo zaposlenika i menadžera, a posljedica svega će biti veća efikasnost rada i uspješnija realizacija strategije poslovanja.