prikaz prve stranice dokumenta Algoritam za računanje profila pogreške za tehnologije za sekvenciranje treće generacije
No public access
master's thesis
Algoritam za računanje profila pogreške za tehnologije za sekvenciranje treće generacije
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2017. urn:nbn:hr:168:445432
Megla, Lucija
University of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing

Institutional repository: FER Repository

Cite this document

Megla, L. (2017). Algoritam za računanje profila pogreške za tehnologije za sekvenciranje treće generacije (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:445432

Megla, Lucija. "Algoritam za računanje profila pogreške za tehnologije za sekvenciranje treće generacije." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:445432

Megla, Lucija. "Algoritam za računanje profila pogreške za tehnologije za sekvenciranje treće generacije." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:445432

Megla, L. (2017). 'Algoritam za računanje profila pogreške za tehnologije za sekvenciranje treće generacije', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, accessed 25 July 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:445432

Megla L. Algoritam za računanje profila pogreške za tehnologije za sekvenciranje treće generacije [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing; 2017 [cited 2024 July 25] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:445432

L. Megla, "Algoritam za računanje profila pogreške za tehnologije za sekvenciranje treće generacije", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, Zagreb, 2017. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:445432

Metadata
TitleAlgoritam za računanje profila pogreške za tehnologije za sekvenciranje treće generacije
Title (english)Computing the Error Profiles of Third Generation Sequencing Technologies
AuthorLucija Megla
MentorMile Šikić (mentor)
Committee memberMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Committee memberAna Sović Kržić (član povjerenstva)
Committee memberKrešimir Križanović (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing
Zagreb
Defense date and country2017-07-10, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		TECHNICAL SCIENCES
Computing
Abstract
Kada se očitanja sastavljaju u duži redoslijed nukleotida i napokon u konsenzus, cilj je reproducirati konsenzus koji je što sličniji referenci. Oxford Nanopore Technologies imaju problema kod sekvenciranja homopolimera. Stoga je razvijen alat koji računa pro- file pogreške homopolimera. Koristeći profile pogrešaka, istrenirani su algoritmi strojnog učenja kako bi predvidjeli stvarnu duljinu homopolimera. U skladu s tim, konsenzus je mi- jenjan kako bi bio što sličniji referenci.
Abstract (english)
When reads are assembled into a longer sequence and finally into a consensus, the goal is to reproduce a consensus that is as similar to the reference as possible. Oxford Nanopore Technologies have issues when sequencing homopolymers. That is why we developed a tool where we found error profiles of homopolymers. Using error profiles we trained ma- chine learning algorithms to predict the real length of homopolymers. Then we altered the consensus accordingly, in order to reach reference sequence.
Keywords
Keywords (english)
Languageenglish
URN:NBNurn:nbn:hr:168:445432
Study programmeTitle: Computing
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsClosed access
Terms of useLicence In copyright icon
Public note
Created on2019-03-13 22:56:43