prikaz prve stranice dokumenta Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom
No public access
master's thesis
Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2015. urn:nbn:hr:168:352075
Čulinović, Marko
University of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing

Institutional repository: FER Repository

Cite this document

Čulinović, M. (2015). Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

Čulinović, Marko. "Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2015. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

Čulinović, Marko. "Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2015. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

Čulinović, M. (2015). 'Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, accessed 17 February 2025, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

Čulinović M. Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing; 2015 [cited 2025 February 17] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

M. Čulinović, "Popravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, Zagreb, 2015. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:352075

Metadata
TitlePopravljanje postojećih genoma koristići dugačka očitanja s velikom greškom
Title (english)Scaffolding Using Long Error-Prone Reads
AuthorMarko Čulinović
MentorMile Šikić (mentor)
Committee memberMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Committee memberDamir Seršić (član povjerenstva)
Committee memberMladen Vučić (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing
Zagreb
Defense date and country2015-07-03, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		TECHNICAL SCIENCES
Computing
Abstract
Popravljanje postojećih genoma koristeći dugačka očitanja s velikom greškom obećavajući je pristup za popunjavanje rupa u nedovršenim genomima. Dvije metode predložene su za produljivanje kontiga. Prva se temelji na lokalnom i globalnom poravnanju očitanja koja su moguća produljenja kontiga, a druga koristi POA algoritam za generiranje konsenzus sekvence iz tih očitanja. Rad metoda testiran je na dva različita skupa podataka dugačkih očitanja - PacBio i Oxford Nanopore Technologies očitanja. Projekt je implementiran u programskom jeziku C++.
Abstract (english)
Scaffolding using long error-prone reads is very promising method for completion of draft genomes. Two methods were proposed for extending contigs in draft genomes. First one is based on local and global realignment of possible extension reads and second one uses POA algorithm for generating consensus sequence from these reads. Program was tested on two different types of long reads, PacBio and Oxford Nanopore Technologies. Project is implemented in C++ programming language.
Keywords
Keywords (english)
Languageenglish
URN:NBNurn:nbn:hr:168:352075
Study programmeTitle: Computing
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsClosed access
Terms of useLicence In copyright icon
Public note
Created on2018-02-06 08:19:46