prikaz prve stranice dokumenta Vrednovanje modela za predikciju udaljenosti između RNA atoma
No public access
master's thesis
Vrednovanje modela za predikciju udaljenosti između RNA atoma
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2022. urn:nbn:hr:168:349812
Šarić, Jelena
University of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing

Institutional repository: FER Repository

Cite this document

Šarić, J. (2022). Vrednovanje modela za predikciju udaljenosti između RNA atoma (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349812

Šarić, Jelena. "Vrednovanje modela za predikciju udaljenosti između RNA atoma." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349812

Šarić, Jelena. "Vrednovanje modela za predikciju udaljenosti između RNA atoma." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349812

Šarić, J. (2022). 'Vrednovanje modela za predikciju udaljenosti između RNA atoma', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, accessed 29 August 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349812

Šarić J. Vrednovanje modela za predikciju udaljenosti između RNA atoma [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing; 2022 [cited 2024 August 29] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349812

J. Šarić, "Vrednovanje modela za predikciju udaljenosti između RNA atoma", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, Zagreb, 2022. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:349812

Metadata
TitleVrednovanje modela za predikciju udaljenosti između RNA atoma
Title (english)Evaluation of RNA Atom Distance Prediction Models
AuthorJelena Šarić
MentorMile Šikić (mentor)
Committee memberMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Committee memberMarko Subašić (član povjerenstva)
Committee memberKrešimir Križanović (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing
Zagreb
Defense date and country2022-02-17, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		TECHNICAL SCIENCES
Computing
Abstract
RNA molekule mogu se savijati i uspostavljati veze same sa sobom. S obzirom na to da takve transformacije kao posljedicu daju bogati spektar trodimenzionalnih struktura i funkcija, znanje o takvim strukturama od velike je važnosti. RNAFold model daje predikciju o trodimenzionalnoj strukturi koristeći metode dubokih neuronskih mreža i prakse koje su pokazale izvanredan napredak u srodnim problemima. Ovaj diplomski rad nastoji analizirati različite konfiguracije modela kako bi se dobio pregled i smjer u prvim fazama implementacije modela. Promatrajući više metrika performanse, cilj je pronaći povezanosti između arhitekture i performanse modela kako bi se ustanovili faktori koji bi mogli unaprijediti trenutnu implementaciju.
Abstract (english)
RNA molecules can fold and form connections with themselves. Since such transformations lead to various possible three-dimensional structures and a diversity of corresponding functions, the knowledge of such structures is of great importance. The RNAFold model predicts a three-dimensional RNA structure using deep learning methods and practices that have shown remarkable progress in related problems. This thesis aims to analyse different model configurations to get an overview and a direction in the first stages of RNAFold’s implementation. By observing multiple performance metrics, the objective is to find a correlation between model architecture and performance, and determine which factors may improve current model implementation.
Keywords
Keywords (english)
Languageenglish
URN:NBNurn:nbn:hr:168:349812
Study programmeTitle: Computing
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsClosed access
Terms of useLicence In copyright icon
Public note
Created on2023-01-13 13:53:56