prikaz prve stranice dokumenta De novo sastavljanje diploidnih genoma koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije
No public access
undergraduate thesis
De novo sastavljanje diploidnih genoma koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2020. urn:nbn:hr:168:780049
Yatsukha, Roman
University of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing

Institutional repository: FER Repository

Cite this document

Yatsukha, R. (2020). De novo sastavljanje diploidnih genoma koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije (Undergraduate thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:780049

Yatsukha, Roman. "De novo sastavljanje diploidnih genoma koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije." Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:780049

Yatsukha, Roman. "De novo sastavljanje diploidnih genoma koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije." Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:780049

Yatsukha, R. (2020). 'De novo sastavljanje diploidnih genoma koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije', Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, accessed 16 June 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:780049

Yatsukha R. De novo sastavljanje diploidnih genoma koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije [Undergraduate thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing; 2020 [cited 2024 June 16] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:780049

R. Yatsukha, "De novo sastavljanje diploidnih genoma koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije", Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, Zagreb, 2020. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:780049

Metadata
TitleDe novo sastavljanje diploidnih genoma koristeći tehnologiju za očitanje DNA treće generacije
Title (english)De Novo Diploid Assembly Using Third-Generation Sequencing Data
AuthorRoman Yatsukha
MentorMile Šikić (mentor)
Committee memberMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Committee memberKrešimir Križanović (član povjerenstva)
Committee memberRobert Vaser (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing
Zagreb
Defense date and country2020-07-06, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		TECHNICAL SCIENCES
Computing
Abstract
Dolaskom treće-generacije tehnologija očitavanja DNA, problem sastavljanja genoma je postao pristupačniji. Potaknuti time, u ovom radu istražujemo problem sastavljanja genoma diploidnog organizma. Uz opis algoritama koji se koriste u različitim fazama sastavljanja genoma diploidnog organizma, pokazujemo primjenu u stvarnom svijetu nadogradnjom Ravena, postojećeg de novo sastavljača genoma, kako bi podržao sastavljanje genoma diploidnih organizama.
Abstract (english)
With the advent of third-generation sequencing technologies, the problem of genome assembly is more approachable than ever. We leverage this to explore diploid genome assembly. In this work we discuss algorithms used in various phases of diploid genome assembly, and adapt Raven, an existing de novo genome assembler to work with diploid organisms.
Keywords
Keywords (english)
Languageenglish
URN:NBNurn:nbn:hr:168:780049
Study programmeTitle: Computing
Study programme type: university
Study level: undergraduate
Academic / professional title: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsClosed access
Terms of useLicence In copyright icon
Public note
Created on2023-01-14 10:17:52