prikaz prve stranice dokumenta Fino strukturno ugađanje heterocikličkih boja na bazi stirila za spektrofotometrijsko prepoznavanje različitih ds-DNA/RNA slijedova
  Download
PDF 2.27 MB
master's thesis
Fino strukturno ugađanje heterocikličkih boja na bazi stirila za spektrofotometrijsko prepoznavanje različitih ds-DNA/RNA slijedova
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Chemical Engineering and Technology, 2022. urn:nbn:hr:149:809039
Pečurlić, Ivona
University of Zagreb
Faculty of Chemical Engineering and Technology

Institutional repository: Repository of Faculty of Chemical Engineering and Technology University of Zagreb

Cite this document

Pečurlić, I. (2022). Fino strukturno ugađanje heterocikličkih boja na bazi stirila za spektrofotometrijsko prepoznavanje različitih ds-DNA/RNA slijedova (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Chemical Engineering and Technology. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:149:809039

Pečurlić, Ivona. "Fino strukturno ugađanje heterocikličkih boja na bazi stirila za spektrofotometrijsko prepoznavanje različitih ds-DNA/RNA slijedova." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Chemical Engineering and Technology, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:149:809039

Pečurlić, Ivona. "Fino strukturno ugađanje heterocikličkih boja na bazi stirila za spektrofotometrijsko prepoznavanje različitih ds-DNA/RNA slijedova." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Chemical Engineering and Technology, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:149:809039

Pečurlić, I. (2022). 'Fino strukturno ugađanje heterocikličkih boja na bazi stirila za spektrofotometrijsko prepoznavanje različitih ds-DNA/RNA slijedova', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Chemical Engineering and Technology, accessed 16 May 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:149:809039

Pečurlić I. Fino strukturno ugađanje heterocikličkih boja na bazi stirila za spektrofotometrijsko prepoznavanje različitih ds-DNA/RNA slijedova [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Chemical Engineering and Technology; 2022 [cited 2024 May 16] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:149:809039

I. Pečurlić, "Fino strukturno ugađanje heterocikličkih boja na bazi stirila za spektrofotometrijsko prepoznavanje različitih ds-DNA/RNA slijedova", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Chemical Engineering and Technology, Zagreb, 2022. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:149:809039

Metadata
TitleFino strukturno ugađanje heterocikličkih boja na bazi stirila za spektrofotometrijsko prepoznavanje različitih ds-DNA/RNA slijedova
Title (english)Fine structural tuning of heterocyclic dyes with a styryl base for spectrophotometric recognition of different ds-DNA/RNA sequences
AuthorIvona Pečurlić
MentorIrena Škorić (mentor)
MentorIvo Piantanida (komentor)
Committee memberIrena Škorić (predsjednik povjerenstva)
Committee memberŽeljka Ujević Andrijić (član povjerenstva)
Committee memberIvo Piantanida (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Chemical Engineering and Technology
Zagreb
Defense date and country2022-09-13, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Chemistry
Abstract
U sklopu ovog diplomskog rada ispitivane su interakcije s molekulama DNA i RNA za četiri stirilne boje, različitih heterocikličkih jezgri te položaja supstituenata. Sve boje imaju strukturu koja sadržava konjugirani sustav te uz pozitivan naboj, pokazuju odlični potencijal za vezanje na polinukleotide. Svi spojevi su karakterizirani uz metode UV/Vis spektrofotometrije i spektrofluorimetrije te preliminarnim ispitivanjima vezanja na DNA, uočena je značajna promjena fluorescencijskog odziva kao naznaka vezanja. UV/Vis te fluorimetrijskim titracijama spojeva s polinukleotidima, ustanovljeno je kako svi spojevi pokazuju afinitet prema vezanju na RNA te ponešto viši afiniteti vidljivi su prema DNA, što je izraženo logaritmom konstante stabilnosti određenih prema Scatchardovoj jednadžbi. Opisujući način vezanja, sve boje pokazuju nespecifično vezanje u utore. Spojevi pokazuju slab stabilizacijski utjecaj na polinukleotide, u većoj mjeri na RNA nego na DNA molekulu.
Abstract (english)
Within this Master's thesis, interactions with DNA and RNA molecules were investigated for four styryl dyes, with different heterocyclic cores and substituent positions. All dyes have a structure that contains a conjugated system and a positive charge, which shows excellent potential for binding to polynucleotides. All compounds were characterized with the UV/Vis spectrophotometry and spectrofluometry methods, and with preliminary DNA binding tests, a significant change in fluorescence response was observed as an indication of binding. By UV/Vis and fluorimetric titrations of compounds with polynucleotides, it was established that all compounds show affinity towards binding to RNA, and slightly higher affinities are visible towards DNA, which are expressed by the logarithm of the stability constant determined according to Scatchard's equation. Describing the mode of binding, all dyes show non-specific binding to the grooves. The compounds show a weak stabilizing effect on polynucleotides, to a greater extent on RNA than on DNA molecules.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:149:809039
ProjectNumber: IP-2018-01-5475
Title: Višekromoforne probe za prepoznavanje pojedinih struktura DNA, RNA i proteina
Acronym: BioMultiChromoProbes
Leader: Ivo Piantanida
Jurisdiction: Croatia
Funder: HRZZ
Funding stream: IP
Study programmeTitle: Chemical Engineering - Graduate study
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra inženjer/inženjerka kemijskog inženjerstva (magistar/magistra inženjer/inženjerka kemijskog inženjerstva)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2023-03-19 17:19:11