prikaz prve stranice dokumenta Molekularna heterogenost virusa humane imunodeficijencije tipa 1 i uloga transmisijskih lanaca u lokalnom širenju infekcije u Hrvatskoj
  Download
PDF 2.8 MB
doctoral thesis
Molekularna heterogenost virusa humane imunodeficijencije tipa 1 i uloga transmisijskih lanaca u lokalnom širenju infekcije u Hrvatskoj
Zagreb: University of Zagreb, School of Medicine, 2020. urn:nbn:hr:105:291812
Oroz, Maja
University of Zagreb
School of Medicine

Institutional repository: Dr Med - University of Zagreb School of Medicine Digital Repository

Cite this document

Oroz, M. (2020). Molekularna heterogenost virusa humane imunodeficijencije tipa 1 i uloga transmisijskih lanaca u lokalnom širenju infekcije u Hrvatskoj (Doctoral thesis). Zagreb: University of Zagreb, School of Medicine. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:291812

Oroz, Maja. "Molekularna heterogenost virusa humane imunodeficijencije tipa 1 i uloga transmisijskih lanaca u lokalnom širenju infekcije u Hrvatskoj." Doctoral thesis, University of Zagreb, School of Medicine, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:291812

Oroz, Maja. "Molekularna heterogenost virusa humane imunodeficijencije tipa 1 i uloga transmisijskih lanaca u lokalnom širenju infekcije u Hrvatskoj." Doctoral thesis, University of Zagreb, School of Medicine, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:291812

Oroz, M. (2020). 'Molekularna heterogenost virusa humane imunodeficijencije tipa 1 i uloga transmisijskih lanaca u lokalnom širenju infekcije u Hrvatskoj', Doctoral thesis, University of Zagreb, School of Medicine, accessed 23 December 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:291812

Oroz M. Molekularna heterogenost virusa humane imunodeficijencije tipa 1 i uloga transmisijskih lanaca u lokalnom širenju infekcije u Hrvatskoj [Doctoral thesis]. Zagreb: University of Zagreb, School of Medicine; 2020 [cited 2024 December 23] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:291812

M. Oroz, "Molekularna heterogenost virusa humane imunodeficijencije tipa 1 i uloga transmisijskih lanaca u lokalnom širenju infekcije u Hrvatskoj", Doctoral thesis, University of Zagreb, School of Medicine, Zagreb, 2020. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:291812

Metadata
TitleMolekularna heterogenost virusa humane imunodeficijencije tipa 1 i uloga transmisijskih lanaca u lokalnom širenju infekcije u Hrvatskoj
Title (english)Molecular diversity of human immunodeficiency virus type 1 and the role of transmission chains in the local spread of infection in Croatia
AuthorMaja Oroz
MentorJosip Begovac (mentor)
MentorSnježana Židovec-Lepej (komentor)
Committee memberTatjana Vilibić Čavlek (predsjednik povjerenstva)
Committee memberFloriana Jakuš (član povjerenstva)
Committee memberAlemka Markotić (član povjerenstva)
Committee memberBranko Kolarić (član povjerenstva)
Committee memberAdriana Vince (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
School of Medicine
Zagreb
Defense date and country2020-12-28, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		BIOMEDICINE AND HEALTHCARE
Clinical Medical Sciences
Infectology
Universal decimal classification
(UDC)		616 - Pathology. Clinical medicine
Abstract
Cilj ove doktorske disertacije bio je istražiti molekularnu epidemiologiju HIV-1 infekcije među prethodno neliječenim HIV-om zaraženim osobama iz Hrvatske. U istraživanje je uključeno 403 ispitanika, odnosno 92,4% svih HIV-om zaraženih osoba koje su ušle u kliničku skrb u Hrvatskoj tijekom vremenskog perioda od 2014. do 2017. godine. Prevalencija primarne rezistencije HIV-1 na inhibitore reverzne transkriptaze (RTI), proteaze (PI) i integraze (InSTI) analizirana je tehnologijom sekvenciranja po Sangeru. Ukupna prevalencija primarne rezistencije na antiretrovirusnu terapiju (ART) iznosila je 16,4%. Prevalencija rezistencija prema pojedinim klasama lijekova, nukleozidnim RTI (NRTI), nenukleozidnim RTI (NNRTI), PI i InSTI iznosila je 11,4%, 6,7%, 2,5% i 1%. U istraživanju je utvrđena i primarna rezistencija na tri klase lijekova kod 2,2% ispitanika. Uz to, 48 ispitanika je nasumično odabrano za analizu mutacija povezanih s primarnom rezistencijom na ART pomoću tehnologije sekvenciranja nove generacije, a dodatne mutacije su pronađene u 6 uzoraka. Filogenetska analiza pokazala je visok postotak klasteriranja (347/403, 86,1%) i identificirala aktivno širenje više mutacija povezanih s rezistencijom u Hrvatskoj, čak i širenje rezistencije na tri klase lijekova. Najveći klaster s mutacijom povezanom s primarnom rezistencijom na ART bio je T215S klaster, formiran od 53 ispitanika, a filodinamičkom analizom je njegov razvoj procijenjen u 1992. godini. Rezultati ove studije ukazuju na kontinuiranu potrebu za nadziranjem primarne rezistencije HIV-1 i razvoja transmisijskih klastera u Hrvatskoj.
Abstract (english)
The aim of this study was to investigate the molecular epidemiology of HIV-1 infection in treatment-naive HIV-1 infected persons from Croatia. Study included 403 persons, representing 92,4% of all HIV-1 positive individuals entering clinical care in Croatia in 2014-2017. The prevalence of transmitted drug resistance (TDR) to reverse transcriptase inhibitors (RTI), protease inhibitors (PI) and integrase strand-transfer inhibitors (InSTI) was assesed by Sanger sequencing. Overall prevalence of TDR was 16,4%. According to drug classes, resistance to nucleoside RTI (NRTI), non-nucleoside RTI (NNRTI), PI and InSTI was found in 11,4%, 6,7%, 2,5% and 1% of individuals, respectively. Triple-class resistance was determined in 2,2% of individuals. In addition, 48 individuals were randomly selected for next generation sequencing and additional TDR mutations were detected in 6 samples. Phylogenetic analysis showed high rate of clustering (347/403, 86,1%) and identified forward transmission of multiple TDR mutations in Croatia, even that of triple-class resistance. The largest cluster harbouring TDR consisted of 53 persons with T215S mutation and phylodinamic analysis estimated to originate in the year 1992. This data shows a continuing need for pre-treatment HIV-1 resistance testing and surveillance of local transmission networks in Croatia.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:105:291812
Study programmeTitle: Biomedicine and Health Sciences
Study programme type: university
Study level: postgraduate
Academic / professional title: doktor/doktorica znanosti, područje biomedicine i zdravstvo (doktor/doktorica znanosti, područje biomedicine i zdravstvo)
Catalog URLhttps://katalog.nsk.hr/F/19IT7Y755V1NXQJPHCLYSQGPF6BLAPPF179HQ7FAXXMYBYGMV5-36292?func=find-e&request=Molekularna+heterogenost+virusa+humane+imunodeficijencije+tipa+1+i+uloga+transmisijskih+lanaca+u+lokalnom+%C5%A1irenju+infekcije+u+Hrvatskoj&find_scan_code=FIND_NAS&adjacent=N&local_base=MF_WEB&x=0&y=0&filter_code_1=WLN&filter_request_1=&filter_code_2=WYR&filter_request_2=&filter_code_3=WYR&filter_request_3=&filter_code_4=WFM&filter_request_4=
Type of resourceText
Extent130 str.
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2021-03-24 12:42:32