prikaz prve stranice dokumenta Identifikacija ključnih mikrobnih vrsta u mikrobioti hrvatske populacije
  Download
PDF 903.45 KB
master's thesis
Identifikacija ključnih mikrobnih vrsta u mikrobioti hrvatske populacije
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Food Technology and Biotechnology, 2023. urn:nbn:hr:159:687825
Krneta, Bruna
University of Zagreb
Faculty of Food Technology and Biotechnology
Department of Biochemical Engineering
Section for Bioinformatics

Institutional repository: Repository of the Faculty of Food Technology and Biotechnology

Cite this document

Krneta, B. (2023). Identifikacija ključnih mikrobnih vrsta u mikrobioti hrvatske populacije (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Food Technology and Biotechnology. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:687825

Krneta, Bruna. "Identifikacija ključnih mikrobnih vrsta u mikrobioti hrvatske populacije." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Food Technology and Biotechnology, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:687825

Krneta, Bruna. "Identifikacija ključnih mikrobnih vrsta u mikrobioti hrvatske populacije." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Food Technology and Biotechnology, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:687825

Krneta, B. (2023). 'Identifikacija ključnih mikrobnih vrsta u mikrobioti hrvatske populacije', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Food Technology and Biotechnology, accessed 10 July 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:687825

Krneta B. Identifikacija ključnih mikrobnih vrsta u mikrobioti hrvatske populacije [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Food Technology and Biotechnology; 2023 [cited 2024 July 10] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:687825

B. Krneta, "Identifikacija ključnih mikrobnih vrsta u mikrobioti hrvatske populacije", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Food Technology and Biotechnology, Zagreb, 2023. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:687825

Metadata
TitleIdentifikacija ključnih mikrobnih vrsta u mikrobioti hrvatske populacije
Title (english)Identification of core microbial species from Croatian population's microbiota
AuthorBruna Krneta
MentorAntonio Starčević (mentor)
MentorJurica Žučko (pomoć pri izradi, neposredni voditelj)
MentorDamir Oros (pomoć pri izradi, neposredni voditelj)
Committee memberBlaženka Kos (predsjednik povjerenstva)
Committee memberJurica Žučko (član povjerenstva)
Committee memberJasna Novak (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Food Technology and Biotechnology
(Department of Biochemical Engineering)
(Section for Bioinformatics)
Zagreb
Defense date and country2023-04-07, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		BIOTECHNICAL SCIENCES
Biotechnology
Abstract
Gastrointestinalna mikrobiota odraz je genetike, načina života i prehrane te je u neposrednoj vezi sa zdravljem pojedinca. Njena uloga u homeostazi organizma je esencijalna te je kao takva predmet sve češćih istraživanja sastava mikrobiote. Hrvatska prati trend urbanizacije, promjene načina života i prehrane koja sve više nalikuje zapadnjačkoj, a rezultat toga je visoka pojavnost pretilosti i kroničnih nezaraznih bolesti. Cilj ovog rada bio je odrediti raznolikost te taksonomski sastav crijevne mikrobiote 59 ispitanika metagenomskom analizom fecesa. Primjenjene su molekularno-genetičke metode lančana reakcija polimerazom i amplikon sekvenciranje, a rezultati su analizirani bioinformatičkom platformom. Širok raspon vrijednosti alfa raznolikosti te visoka razina beta raznolikosti potvrdile su značajne interpersonalne varijacije raznolikosti sastava. Biomarker pretilosti - povećan omjer koljena Firmicutes naspram Bacteroidota prisutan je u > 22 % ispitanika. Dominantni rodovi odraz su prehrane s prekomjernim unosom ugljikohidrata, animalnih proteina i zasićenih masti. U ispitanika narušenog zdravlja utvrđene su promjene zastupljenosti određenih bakterijskih rodova.
Abstract (english)
Gastrointestinal microbiota is affected by genetics, lifestyle and diet, and is correlated with health. Its role in organisms’ homeostasis is essential so microbiota has become a common research topic lately. Croatia follows a trend of urbanization, lifestyle and dietary changes belonging to a western culture dietary patterns that results with high occurrence of obesity and chronic diseases. The aim of this work was to determine diversity and taxonomy composition of microbiota of 59 individuals by feces metagenomic analysis. Methods including polymerase chain reaction and amplicon sequencing were applied and the obtained results were analyzed. Wide range of alpha diversity values and high beta diversity confirmed significant interpersonal variations of compositional diversity. The biomarker of obesity – high Firmicutes to Bacteroidota ratio was detected in > 22 % of participants. Key bacterial genera reflect the diet that includes high intake of carbohydrates, animal proteins and saturated fats. Relative abundances of specific genera are correlated in microbiota of unhealthy individuals.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:159:687825
Study programmeTitle: Molecular Biotechnology
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra inženjer/inženjerka molekularne biotehnologije (magistar/magistra inženjer/inženjerka molekularne biotehnologije)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence Attribution-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-ND 4.0) icon
Created on2024-05-21 12:31:27