prikaz prve stranice dokumenta Priprema krnjih oblika izoleucil-tRNA-sintetaze 2 iz bakterije Bacillus megaterium i karakterizacija njihove funkcionalnosti
  Download
PDF 9.35 MB
master's thesis
Priprema krnjih oblika izoleucil-tRNA-sintetaze 2 iz bakterije Bacillus megaterium i karakterizacija njihove funkcionalnosti
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2022. urn:nbn:hr:217:338820
Škulac, Melody
University of Zagreb
Faculty of Science
Department of Chemistry

Institutional repository: Repository of the Faculty of Science

Cite this document

Škulac, M. (2022). Priprema krnjih oblika izoleucil-tRNA-sintetaze 2 iz bakterije Bacillus megaterium i karakterizacija njihove funkcionalnosti (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:338820

Škulac, Melody. "Priprema krnjih oblika izoleucil-tRNA-sintetaze 2 iz bakterije Bacillus megaterium i karakterizacija njihove funkcionalnosti." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:338820

Škulac, Melody. "Priprema krnjih oblika izoleucil-tRNA-sintetaze 2 iz bakterije Bacillus megaterium i karakterizacija njihove funkcionalnosti." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:338820

Škulac, M. (2022). 'Priprema krnjih oblika izoleucil-tRNA-sintetaze 2 iz bakterije Bacillus megaterium i karakterizacija njihove funkcionalnosti', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, accessed 21 December 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:338820

Škulac M. Priprema krnjih oblika izoleucil-tRNA-sintetaze 2 iz bakterije Bacillus megaterium i karakterizacija njihove funkcionalnosti [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science; 2022 [cited 2024 December 21] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:338820

M. Škulac, "Priprema krnjih oblika izoleucil-tRNA-sintetaze 2 iz bakterije Bacillus megaterium i karakterizacija njihove funkcionalnosti", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, Zagreb, 2022. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:338820

Metadata
TitlePriprema krnjih oblika izoleucil-tRNA-sintetaze 2 iz bakterije Bacillus megaterium i karakterizacija njihove funkcionalnosti
Title (english)Preparation and functional characterization of truncated forms of isoleucyl-tRNA synthetase 2 from Bacillus megaterium
AuthorMelody Škulac
MentorIta Gruić Sovulj (mentor)
Committee memberIta Gruić Sovulj (predsjednik povjerenstva)
Committee memberVesna Petrović Peroković (član povjerenstva)
Committee memberIva Juranović Cindrić (član povjerenstva)
Committee memberMarko Močibob (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Science
(Department of Chemistry)
Zagreb
Defense date and country2022-12-14, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Chemistry
Abstract
Izoleucil-tRNA-sintetaza (IleRS) je enzim koji katalizira nastajanje izoleucil-tRNAIle u dva koraka; izoleucin se prvo aktivira uz pomoć ATP-a pa prenosi na tRNAIle . Enzim posjeduje modularnu građu s katalitičkom domenom koja je evolucijski najstarija. Izolacija samostojeće katalitičke domene zato predstavlja prvi korak u pripremi ancestralnih oblika. IleRS spada u skupinu drevnih i za život presudnih enzima što čini njegovu ancestralnu rekonstrukciju važnom za razumijevanje evolucije biosinteze proteina, ključnog staničnog procesa. U sklopu ovog diplomskog rada proizvedena su i kinetički okarakterizirana dva funkcionalno-minimalna (krnja) oblika IleRS2 iz bakterije Bacillus megaterium nastala uklanjanjem C-terminalne, korektivne i CP2 domene iz cjelovitog oblika. Topljivost krnjih oblika IleRS bila je niska što predstavlja veliki izazov za daljnja istraživanja. Kinetička karakterizacija pokazala je da oba krnja oblika posjeduju aminoacilacijsku aktivnost koja je 3-4 reda veličine manja nego kod cjelovite IleRS. Dobiveni rezultati ukazuju da su konstruirani krnji oblici IleRS2 dobri modeli za daljnje istraživanje ancestralnih oblika IleRS.
Abstract (english)
Isoleucyl-tRNA synthetase (IleRS) catalyzes the formation of isoleucyl-tRNAIle in two steps; ATP-dependent isoleucine activation is followed by isoleucine transfer to the tRNAIle . The enzyme is modular with the catalytic domain being the most ancient. Hence, the isolation of a freestanding catalytic domain represents the first step in the design of IleRS ancestral forms. IleRS belongs to a group of ancient and life-essential enzymes whose ancestral reconstruction is relevant for understanding the evolution of protein biosynthesis, a key cellular process. Within this thesis, we prepared and kinetically characterized two functionally minimal (truncated) forms of IleRS2 from the bacteria Bacillus megaterium designed by omitting the C-terminal, editing, and CP2 domains. The solubility of these forms was low, representing a challenge for further research. Kinetic characterization showed that both forms are active with 3-4 orders of magnitude lower aminoacylation rates compared to full-length IleRS. Our results suggest these truncated forms are suitable models for further research of IleRS ancestral forms.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:217:338820
Study programmeTitle: Graduate university studies in chemistry; specializations in: Research programme
Course: Research programme
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra kemije (magistar/magistra kemije)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2022-12-23 09:16:29