prikaz prve stranice dokumenta Rasprostranjivanje gena za rezistenciju na cefalosporine treće generacije među bakterijama komunalnih otpadnih voda
  Download
PDF 985.76 KB
master's thesis
Rasprostranjivanje gena za rezistenciju na cefalosporine treće generacije među bakterijama komunalnih otpadnih voda
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2023. urn:nbn:hr:217:701563
Kodela Pacenti, Ivan
University of Zagreb
Faculty of Science
Department of Biology

Institutional repository: Repository of the Faculty of Science

Cite this document

Kodela Pacenti, I. (2023). Rasprostranjivanje gena za rezistenciju na cefalosporine treće generacije među bakterijama komunalnih otpadnih voda (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:701563

Kodela Pacenti, Ivan. "Rasprostranjivanje gena za rezistenciju na cefalosporine treće generacije među bakterijama komunalnih otpadnih voda." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:701563

Kodela Pacenti, Ivan. "Rasprostranjivanje gena za rezistenciju na cefalosporine treće generacije među bakterijama komunalnih otpadnih voda." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:701563

Kodela Pacenti, I. (2023). 'Rasprostranjivanje gena za rezistenciju na cefalosporine treće generacije među bakterijama komunalnih otpadnih voda', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, accessed 18 May 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:701563

Kodela Pacenti I. Rasprostranjivanje gena za rezistenciju na cefalosporine treće generacije među bakterijama komunalnih otpadnih voda [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science; 2023 [cited 2024 May 18] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:701563

I. Kodela Pacenti, "Rasprostranjivanje gena za rezistenciju na cefalosporine treće generacije među bakterijama komunalnih otpadnih voda", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, Zagreb, 2023. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:701563

Metadata
TitleRasprostranjivanje gena za rezistenciju na cefalosporine treće generacije među bakterijama komunalnih otpadnih voda
Title (english)Dissemination of genes encoding resistance to third generation cephalosporins among bacteria from municipal wastewater
AuthorIvan Kodela Pacenti
MentorNikolina Udiković Kolić (mentor)
MentorJasna Hrenović (komentor)
Committee memberJasna Hrenović (predsjednik povjerenstva)
Committee memberTomislav Ivanković (član povjerenstva)
Committee memberGoran Klobučar (član povjerenstva)
Committee memberŽeljka Vidaković-Cifrek (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Science
(Department of Biology)
Zagreb
Defense date and country2023-09-22, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Biology
Abstract
Bakterijska otpornost na antibiotike predstavlja značajnu prijetnju za ljudsko zdravlje zbog ograničenih mogućnosti u liječenju infektivnih bolesti. Cefalosporini treće generacije su antibiotici koji se koriste u liječenju mnogih infekcija, ali Gram-negativne bakterije ih mogu uspješno hidrolizirati pomoću β-laktamaza proširenog spektra (ESBL), čiji geni se uglavnom nalaze na plazmidima. Važnu ulogu u širenju te otpornosti imaju uređaji za pročišćavanje otpadnih voda (UPOV) unutar kojih bakterije, pod pritiskom antibiotika i drugih zagađivala, izmjenjuju gene za otpornost putem plazmida. U ovom istraživanju korištena je metoda egzogene izolacije plazmida za analizu prijenosa ESBL gena iz bakterija pročišćenih otpadnih voda iz sedam UPOV-a u bakteriju primatelj Escherichia coli CV601. Dobiveno je 18 pozitivnih transkonjuganata (E. coli CV601 s ESBL genom na plazmidu) iz pet analiziranih UPOV-a. Većina transkonjuganata je ispoljavala višestruko otporan fenotip potvrđen metodama disk difuzije i mikrodilucije. Primjenom metoda lančane reakcije polimeraze (PCR) i agarozne gel elekroforeze, na svim plazmidima pozitivnih transkonjuganata potvrđena je prisutnost ESBL gena blaCTX-M-1 i blaTEM, dok je na jednom plazmidu dodatno detektiran gen blaGES. Osam plazmida je dodatno nosilo gen za karbapenemazu blaVIM ili blaNDM. Primjenom PCR metode za određivanje replikona, u svim pozitivnim transkonjugantima potvrđena je prisutnost jednog do tri plazmida koji su po tipu replikona većinom pripadali skupini inkopatibilnosti IncL/M.
Abstract (english)
Bacterial resistance to antibiotics poses a significant threat to human health due to limited treatment options in the treatment of infectious diseases. Third-generation cephalosporins are antibiotics used to treat many infections, but Gram-negative bacteria can successfully hydrolyze them using extended-spectrum β-lactamases (ESBL), whose genes are usually found on plasmids. Wastewater treatment plants (WWTPs) play an important role in the spread of this resistance because bacteria there exchange resistance genes via plasmids under the pressure of antibiotics and other contaminants. In this study, the exogenous plasmid isolation method was used to analyze the transfer of ESBL genes from bacteria in treated wastewater from seven WWTPs to the recipient bacterium, Escherichia coli CV601. Eighteen positive transconjugants (E. coli CV601 with ESBL gene on plasmid) were obtained from five WWTPs studied. Most of the transconjugants exhibited a multidrug-resistant phenotype, which was confirmed by disk diffusion and microdilution methods. PCR and agarose gel electrophoresis confirmed the presence of the ESBL genes blaCTX-M-1 and blaTEM on all plasmids of the positive transconjugants, with the additional detection of the blaGES gene on one plasmid. Eight plasmids also carried the carbapenemase genes blaVIM or blaNDM. Using the polymerase chain reactionbased replicon typing (PBRT) method, the presence of one to three plasmids belonging mainly to the IncL/M incompatibility group was confirmed for all positive transconjugants.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:217:701563
ProjectNumber: IP-2019-04-5539
Title: Antibiotička rezistencija u uređajima za obradu otpadnih voda u Hrvatskoj: naglasak na ß-laktamaze proširenog spektra i karbapenemaze
Title: Antibiotic Resistance in Wastewater Treatment Plants in Croatia: Focus on Extended-Spectrum ß-Lactamases and Carbapenemases
Acronym: WasteCare
Leader: Nikolina Udiković Kolić
Jurisdiction: Croatia
Funder: HRZZ
Funding stream: IP
Study programmeTitle: Ecology
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra ekologije i zaštite prirode (magistar/magistra ekologije i zaštite prirode)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2023-10-25 08:34:47