prikaz prve stranice dokumenta Identifikacija i kvantifikacija proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) ekotipova uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) nakon izlaganja suši
  Download
PDF 3.6 MB
master's thesis
Identifikacija i kvantifikacija proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) ekotipova uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) nakon izlaganja suši
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2018. urn:nbn:hr:217:350906
Bračun, Laura
University of Zagreb
Faculty of Science
Department of Biology

Institutional repository: Repository of the Faculty of Science

Cite this document

Bračun, L. (2018). Identifikacija i kvantifikacija proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) ekotipova uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) nakon izlaganja suši (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:350906

Bračun, Laura. "Identifikacija i kvantifikacija proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) ekotipova uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) nakon izlaganja suši." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:350906

Bračun, Laura. "Identifikacija i kvantifikacija proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) ekotipova uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) nakon izlaganja suši." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:350906

Bračun, L. (2018). 'Identifikacija i kvantifikacija proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) ekotipova uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) nakon izlaganja suši', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, accessed 14 May 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:350906

Bračun L. Identifikacija i kvantifikacija proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) ekotipova uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) nakon izlaganja suši [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science; 2018 [cited 2024 May 14] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:350906

L. Bračun, "Identifikacija i kvantifikacija proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) ekotipova uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) nakon izlaganja suši", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, Zagreb, 2018. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:350906

Metadata
TitleIdentifikacija i kvantifikacija proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) ekotipova uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) nakon izlaganja suši
Title (english)Quantification and identification of intrinsically disordered proteins (IDPs) in different ecotypes of Arabidopsis thaliana L. after exposure to drought
AuthorLaura Bračun
MentorDubravko Pavoković (mentor)
Committee memberDubravko Pavoković (predsjednik povjerenstva)
Committee memberMirta Tkalec (član povjerenstva)
Committee memberSilvija Černi (član povjerenstva)
Committee memberIvana Šola (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Science
(Department of Biology)
Zagreb
Defense date and country2018-02-23, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Biology
Abstract
Nedostatak vode jedan je od glavnih čimbenika okolišnog stresa, a s obzirom na klimatsku regiju, on može biti dugotrajan ili kratkotrajan i nasumičan. Sesilni organizmi poput biljaka morali su razviti posebne strategije kojima prebrođuju i preživljavaju sušna razdoblja. Neke od tih strategija variraju s obzirom na genotip. U sklopu ovog diplomskog rada, suši su izložena četiri ekotipa biljke Arabidopsis thaliana, porijeklom iz četiri različite klimatske regije. Razlike u toleranciji nedostatka vode ustanovljene su na razini proteoma. Uspoređivane su aktivnosti peroksidaze kao izravan pokazatelj jačine oksidativnog stresa, relativne koncentracije Hsp70 (engl. heat-shock protein) kao indikatora generalnog stresa, i relativne koncentracije proteina djelomično neuređene strukture (IDP) koji sudjeluju u integraciji signalnih puteva te stoga imaju bitnu ulogu u mnogim biljnim procesima, uključujući one koji odgovaraju na abiotički stres. Utvrđeno je povećanje aktivnosti peroksidaze i ekspresije Hsp70 u sušnim uvjetima u usporedbi s kontrolom. Uočena je i promjena ekspresije nekih IDP u uvjetima suše s obzirom na kontrolu. Također, spektrometrijom masa identificirano je 25 IDP, a potom je razina njihove neuređenosti određena bioinformatičkim alatima. Za 21 protein potvrđeno je da posjeduju barem jednu dugu neuređenu regiju.
Abstract (english)
Water deficit is one of the crucial factors causing environmental stress and it can be, considering a particular climate region, either long-term or short-term and random. Sessile organisms like plants had to develop special strategies in order to overcome and survive periods of drought, some of which vary depending on the genotype. This thesis involves exposure to drought of four different ecotypes of Arabidopsis thaliana native to different climate regions and establishing their relative tolerance to water deficit on the level of proteome. We compared peroxidase activities as indicator of oxidative stress and relative concentrations of Hsp70 (heatshock protein) as indicator of general stress. We also determined relative concentrations of intrinsically disordered proteins (IDPs) as they are involved in integration of various signalling pathways and therefore take part in many plant processes in general, including abiotic stress responses. Compared to control, a rise was shown in both peroxidase activity and Hsp70 expression during drought conditions. Expression of some IDPs also changed after exposure to drought in comparison to control. Also, 25 IDPs were identified by mass spectrometry and their sequence structure disorder has been evaluated by bioinformatic tools. Twenty one of them were confirmed to have at least one long disordered region.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:217:350906
Study programmeTitle: Molecular Biology
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra molekularne biologije (magistar/magistra molekularne biologije)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Embargo expiration date: 2020-02-23
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2018-03-15 13:05:22