prikaz prve stranice dokumenta Povezanost signalnog puta NMD s alternativnim produljenjem telomera i preživljenjem stanica Saccharomyces cerevisiae
  Download
PDF 1.16 MB
master's thesis
Povezanost signalnog puta NMD s alternativnim produljenjem telomera i preživljenjem stanica Saccharomyces cerevisiae
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2017. urn:nbn:hr:217:146329
Kavšek, Alan
University of Zagreb
Faculty of Science
Department of Biology

Institutional repository: Repository of the Faculty of Science

Cite this document

Kavšek, A. (2017). Povezanost signalnog puta NMD s alternativnim produljenjem telomera i preživljenjem stanica Saccharomyces cerevisiae (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:146329

Kavšek, Alan. "Povezanost signalnog puta NMD s alternativnim produljenjem telomera i preživljenjem stanica Saccharomyces cerevisiae." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:146329

Kavšek, Alan. "Povezanost signalnog puta NMD s alternativnim produljenjem telomera i preživljenjem stanica Saccharomyces cerevisiae." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:146329

Kavšek, A. (2017). 'Povezanost signalnog puta NMD s alternativnim produljenjem telomera i preživljenjem stanica Saccharomyces cerevisiae', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, accessed 23 December 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:146329

Kavšek A. Povezanost signalnog puta NMD s alternativnim produljenjem telomera i preživljenjem stanica Saccharomyces cerevisiae [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science; 2017 [cited 2024 December 23] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:146329

A. Kavšek, "Povezanost signalnog puta NMD s alternativnim produljenjem telomera i preživljenjem stanica Saccharomyces cerevisiae", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, Zagreb, 2017. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:146329

Metadata
TitlePovezanost signalnog puta NMD s alternativnim produljenjem telomera i preživljenjem stanica Saccharomyces cerevisiae
Title (english)Investigating the link between nonsense-mediated mRNA decay pathway and survivor formation in Saccharomyces cerevisiae
AuthorAlan Kavšek
MentorMichael Chang (mentor)
MentorVlatka Zoldoš (mentor)
Committee memberVlatka Zoldoš (predsjednik povjerenstva)
Committee memberDamjan Franjević (član povjerenstva)
Committee memberJasna Hrenović (član povjerenstva)
Committee memberIvana Ivančić Baće (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Science
(Department of Biology)
Zagreb
Defense date and country2017-02-27, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Biology
Abstract
Degradacija molekula mRNA s besmislenim mutacijama (NMD) kontrolni je mehanizam koji selektivno razgrađuje mRNA s preuranjenim završnim kodonom (PTC). Istraživanja pokazuju da NMD regulira i koncentraciju mnogih mRNA koje ne sadrže PTC te da je time uključen u kontrolu određenih staničnih procesa, konkretno nastanak preživjelih stanica tipa II. Ovo istraživanje ispituje ovisnost nastanka takvih stanica o ekspresiji gena UPF1, UPF2 i UPF3, koji čine NMD u S. cerevisiae te gena EBS1, koji literatura povezuje s NMD. Također se istražuje direktna veza između NMD i nastanka preživjelih stanica tipa II, a kao vjerojatni kandidati su odabrani proteini Stn1 i Rad51. Rezultati pokazuju kako nastanak preživjelih stanica tipa II nije onemogućen pojačanom ekspresijom gena STN1. Potrebno je ipak ispitati može li pojačana ekspresija gena STN1 djelomično ometati nastanak takvih stanica. U mutanata s pojačanom ekspresijom gena RAD51 nastanak preživjelih stanica spomenutog tipa nije primijećen. Ulogu tog gena kao veze između NMD i formiranja preživjelih stanica tipa II treba, međutim, dodatno ispitati jer je na rezultate mogao utjecati način provođenja eksperimenta. Opažanja opisana u radu podržavaju hipotezu da je NMD uključen u regulaciju nastanka preživjelih stanica tipa II, ali potrebna su dalja istraživanja kako bi se preciznije odredila priroda te veze.
Abstract (english)
Nonsense-mediated mRNA decay (NMD) is a eukaryotic mechanism of RNA surveillance that selectively degrades transcripts containing premature termination codons (PTC). Previous studies suggest that this pathway also regulates the abundance of many cellular mRNAs without a PTC. It is therefore very likely that it surveils certain cellular processes, among them regulation of type II survivor formation. This study tests whether the generation of type II survivors depends on the three genes composing NMD in S. cerevisiae – UPF1, UPF2 and UPF3. Dependency of this process on EBS1 is also examined because this gene is supposed to be connected to NMD. Furthermore, the exact connection between NMD and type II survivor formation is studied and two proteins, namely Stn1 and Rad51, are chosen as likely candidates for this link. In the case of STN1, results suggest that type II survivor generation is not blocked by overexpression of this gene. Whether it is partially impaired remains to be checked. Type II survivors have not been detected in mutants with RAD51 overexpression but the results may have been influenced by the way in which the assay was carried out. The observations made in this study enable a general conclusion that NMD is most likely involved in the regulation of type II survivors, while the exact link remains to be discovered.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:217:146329
Study programmeTitle: Molecular Biology
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra molekularne biologije (magistar/magistra molekularne biologije)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2017-04-20 12:37:18