prikaz prve stranice dokumenta Raznolikost gena DRB1 skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti u divljih svinja (Sus scrofa) s područja Medvednice
  Download
PDF 821.86 KB
master's thesis
Raznolikost gena DRB1 skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti u divljih svinja (Sus scrofa) s područja Medvednice
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2015. urn:nbn:hr:217:614981
Balažin, Maja
University of Zagreb
Faculty of Science
Department of Biology

Institutional repository: Repository of the Faculty of Science

Cite this document

Balažin, M. (2015). Raznolikost gena DRB1 skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti u divljih svinja (Sus scrofa) s područja Medvednice (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:614981

Balažin, Maja. "Raznolikost gena DRB1 skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti u divljih svinja (Sus scrofa) s područja Medvednice." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2015. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:614981

Balažin, Maja. "Raznolikost gena DRB1 skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti u divljih svinja (Sus scrofa) s područja Medvednice." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2015. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:614981

Balažin, M. (2015). 'Raznolikost gena DRB1 skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti u divljih svinja (Sus scrofa) s područja Medvednice', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, accessed 22 November 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:614981

Balažin M. Raznolikost gena DRB1 skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti u divljih svinja (Sus scrofa) s područja Medvednice [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science; 2015 [cited 2024 November 22] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:614981

M. Balažin, "Raznolikost gena DRB1 skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti u divljih svinja (Sus scrofa) s područja Medvednice", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, Zagreb, 2015. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:614981

Metadata
TitleRaznolikost gena DRB1 skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti u divljih svinja (Sus scrofa) s područja Medvednice
Title (english)Variability of major histocompatibility complex class II DRB1 gene in wild boars (Sus scrofa) from Medvednica
AuthorMaja Balažin
MentorAna Galov (mentor)
Committee memberAna Galov (predsjednik povjerenstva)
Committee memberGordana Lacković-Venturin (član povjerenstva)
Committee memberBožena Mitić (član povjerenstva)
Committee memberRenata Matoničkin Kepčija (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Science
(Department of Biology)
Zagreb
Defense date and country2015-10-20, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Biology
Abstract
Glavni sustav tkivne podudarnosti (engl. major histocompatibility complex, MHC) ključan je u pokretanju obrambenih mehanizama kralježnjaka, a smatra se da su neki od MHC lokusa među najpolimorfnijim u kralježnjaka. Raznolikost MHC gena utječe na sposobnost populacije da se obrani od različitih patogena. Glavni sustav tkivne podudarnosti kod svinja naziva se SLA (engl. swine leukocyte antigen). Divlja svinja (Sus scrofa) je jedna od najprilagođenijih vrsta kralježnjaka, te kao domadar mnogim parazitima pogodna je vrsta za istraživanje korelacije između MHC haplotipa i podložnosti bolestima. Cilj istraživanja bio je otkriti imunogenetičku raznolikost u populacija divlje svinje s područja Medvednice analizom lokusa DRB1. U istraživanom uzorku od 49 jedinki, pronađeno je sedam alela, od čega je jedan novi alel. Prema omjeru nesinonimnih i sinonimnih supstitucija potvrdili smo da na DRB1 lokus ne djeluje pozitivna selekcija. Dodatnom analizom djelovanja selekcije na pojedinačnim kodonima, utvrdili smo da je jedino kodon 48 pod utjecajem pozitivne selekcije. Rezultati ovog istraživanja će poslužiti za daljna istraživanja korelacija između MHC haplotipova i specifičnih parazitskih bolesti divljih svinja, što će u konačnici pridonijeti razumijevanju koevolucije domaćina i patogena i održavanja genetičke raznolikosti u populacijama životinja.
Abstract (english)
Major histocompatibility complex (MHC) plays a major role in initiating defense mechanisms of vertebrates. It is believed that some of the MHC loci are the most polymorphic in vertebrates. The variability of MHC genes affects population`s ability to defend itself from various pathogens. Major histocompatibility complex (MHC) of pigs is known as swine leukocyte antigen (SLA). Wild boar is considered one of the most widespread species. As host of many parasites it is suitable species for testing correlation between MHC haplotypes and susceptibility to diseases. The goal of the research was to discover imunogenetic diversity in the population of wild boars from Medvednica by analysis of DRB1 loci. In the examined sample of 49 individuals, seven alleles were found, one of them was new. According to the ratio of nonsynonymous and synonymous substitutions we have confirmed that the DRB1 locus isn`t under positive selection. An additional analysis of the effects of selection on individual codons showed us that only codon 48 is under the effect of positive selection. Results of this study will be used in further study of correlation between the MHC haplotypes and specific parasitic diseases of wild boars that will contribute to understanding of coevolution of the host and pathogen and maintenance of genetic diversity in animal populations.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:217:614981
Study programmeTitle: Experimental Biology
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra eksperimentalne biologije (magistar/magistra eksperimentalne biologije)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2017-04-21 08:45:56