prikaz prve stranice dokumenta Biokemijska i funkcionalna karakterizacija enzima auksin-amidohidrolaze BrILL2 iz kineskoga kupusa (Brassica rapa L. ssp. pekinensis)
  Download
PDF 4.92 MB
doctoral thesis
Biokemijska i funkcionalna karakterizacija enzima auksin-amidohidrolaze BrILL2 iz kineskoga kupusa (Brassica rapa L. ssp. pekinensis)
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2019. urn:nbn:hr:217:487660
Smolko, Ana
University of Zagreb
Faculty of Science
Department of Chemistry

Institutional repository: Repository of the Faculty of Science

Cite this document

Smolko, A. (2019). Biokemijska i funkcionalna karakterizacija enzima auksin-amidohidrolaze BrILL2 iz kineskoga kupusa (Brassica rapa L. ssp. pekinensis) (Doctoral thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:487660

Smolko, Ana. "Biokemijska i funkcionalna karakterizacija enzima auksin-amidohidrolaze BrILL2 iz kineskoga kupusa (Brassica rapa L. ssp. pekinensis)." Doctoral thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:487660

Smolko, Ana. "Biokemijska i funkcionalna karakterizacija enzima auksin-amidohidrolaze BrILL2 iz kineskoga kupusa (Brassica rapa L. ssp. pekinensis)." Doctoral thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:487660

Smolko, A. (2019). 'Biokemijska i funkcionalna karakterizacija enzima auksin-amidohidrolaze BrILL2 iz kineskoga kupusa (Brassica rapa L. ssp. pekinensis)', Doctoral thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, accessed 04 November 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:487660

Smolko A. Biokemijska i funkcionalna karakterizacija enzima auksin-amidohidrolaze BrILL2 iz kineskoga kupusa (Brassica rapa L. ssp. pekinensis) [Doctoral thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science; 2019 [cited 2024 November 04] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:487660

A. Smolko, "Biokemijska i funkcionalna karakterizacija enzima auksin-amidohidrolaze BrILL2 iz kineskoga kupusa (Brassica rapa L. ssp. pekinensis)", Doctoral thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, Zagreb, 2019. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:487660

Metadata
TitleBiokemijska i funkcionalna karakterizacija enzima auksin-amidohidrolaze BrILL2 iz kineskoga kupusa (Brassica rapa L. ssp. pekinensis)
Title (english)Biochemical and functional characterization of an auxin amidohydrolase enzyme BrILL2 from Chinese cabbage (Brassica rapa L. ssp. pekinensis)
AuthorAna Smolko
MentorBranka Salopek-Sondi (mentor)
Committee memberMarko Močibob (predsjednik povjerenstva)
Committee memberBranka Salopek-Sondi (član povjerenstva)
Committee memberNataša Bauer (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Science
(Department of Chemistry)
Zagreb
Defense date and country2019-09-17, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Chemistry
Universal decimal classification
(UDC)		54 - Chemistry. Crystallography. Mineralogy
Abstract
Auksin-amidohidrolaza ILL2 biljni je enzim iz porodice metalopeptidaza M20, koji specifično hidrolizira amidnu vezu u inaktivnim konjugatima auksina s aminokiselinama oslobađajući slobodan aktivan auksin. Homolog ILL2 iz kineskoga kupusa (Brassica rapa L. ssp. pekinensis) biokemijski je okarakteriziran te je objašnjena uloga očuvanih aminokiselinskih ostataka Cys139, Cys320, Phe385, Arg295 i Met367 u enzimskoj aktivnosti i stabilnosti proteina te vezanju metala. Predložena je aktivacija BrILL2 in vivo disocijacijom oligomernih formi enzima uz prisustvo prirodnih reducensa. Supstratna specifičnost enzima BrILL2 prema konjugatima dugolančanih auksina, kao i hidroliza tih konjugata in vivo potvrđena je koristeći tzv. „feeding“ eksperimente. Auksinski metabolom po prvi put je opisan za mutante s disfunkcionalnim amidohidrolazama. Utvrđena je preraspodjela slobodnog auksina u biljkama po tretmanu konjugatima dugolančanih auksina, izražena kroz pojačanu konjugaciju auksina te oksidaciju suviška auksina. Akumulacija auksina u korijenu klijanaca reporterske linije uročnjaka (Arabidopsis thaliana) DR5rev::GFP ukazuje na rani odgovor biljaka na tretman auksinima.
Abstract (english)
Auxin-amidohydrolase ILL2 is a plant enzyme from the M20 metalopeptidases family, which specifically hydrolyses amide bond in inactive auxin conjugates with amino acids thereby releasing free active auxin. Homologue ILL2 from Chinese cabbage (Brassica rapa L. ssp. pekinensis) was biochemically characterized and the role of preserved amino acid residues Cys139, Cys320, Phe385, Arg295 and Met367 in enzymatic activity, protein stability and metal binding was explained. Activation of BrILL2 was proposed by dissociation of oligomeric forms of the enzyme in vivo in presence of natural reductants. Substrate specificity of BrILL2 enzyme towards long-chain auxin conjugates, as well as hydrolysis of these conjugates in vivo, has been confirmed using feeding experiments. Auxin metabolome was described for mutants with dysfunctional amidohydrolases. A change in auxin distribution was determined in plants upon treatment with long-chain auxin conjugates, expressed through enhanced auxin conjugation, and oxidation of surplus of auxin. Accumulation of auxin in the root of Arabidopsis thaliana reporter line DR5rev::GFP suggests an early plant response to auxins’ treatment.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:217:487660
Study programmeTitle: Doctoral study in chemistry
Study programme type: university
Study level: postgraduate
Academic / professional title: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje kemija (doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje kemija)
Type of resourceText
Extent143 str. ; 30 cm
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Embargo expiration date: 2021-09-20
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2019-09-27 09:30:07