Proteinski kompleks Ccr4-Not je uključen u regulaciju ekspresije gena u eukariotskim stanicama na više razina, od inicijacije transkripcije do degradacije molekula RNA (Collart, 2016). Duge nekodirajuće molekule RNA (eng. long non-coding RNA, lncRNA), koje su transkripti heterokromatinskih sekvenci, također su pod nadzorom ovog kompleksa. U kvasca Schizosaccharomyces pombe, nakupljanje lncRNA unutar jezgre rezultira gubitkom heterokromatina i narušava integritet kromosoma; stoga ih je potrebno ukloniti za očuvanje strukture heterokromatina. Prema tome, Ccr4-Not je neophodan za održavanje organizacije heterokromatina, putem razgradnje transkripata lncRNA (Brönner i sur., 2017). Cilj ovog rada je odrediti promjenu u razini prepisivanja heterokromatinskih područja u različitim mutantama podjedinica kompleksa Ccr4-Not te istražiti koji su stanični putevi zahvaćeni kada je ovaj kompleks izvan funkcije. U tu svrhu primijenjena je metoda RNA imunoprecipitacije popraćena sekvenciranjem nove generacije (RIP-seq). Pomoću specifičnog antitijela protiv RNA polimeraze II, transkripti koji potječu od heterokromatina su izolirani i pripremljene su biblioteke RNA. Visoko protočno sekvenciranje biblioteka RNA je izvedeno na platformi Illumina GA IIX. Podaci o sekvenciranju obrađeni su i analizirani različitim bioinformatičkim alatima. Usporedba transkripcije između divljeg tipa i mutantnih sojeva S. pombe omogućila je kvantificiranje promjene u prepisivanju heterokromatina, detektiranje gena čija je transkripcija povećana te otkrivanje oštećenih staničnih procesa i metaboličkih puteva u mutantama kompleksa Ccr4-Not.