prikaz prve stranice dokumenta Filogenetski odnosi unutar roda Aurinia Desv. (Brassicaceae) utvrđeni analizom regije ndhF kloroplastne DNA
  Download
PDF 3.01 MB
master's thesis
Filogenetski odnosi unutar roda Aurinia Desv. (Brassicaceae) utvrđeni analizom regije ndhF kloroplastne DNA
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2019. urn:nbn:hr:217:360444
Bartolić, Paolo
University of Zagreb
Faculty of Science
Department of Biology

Institutional repository: Repository of the Faculty of Science

Cite this document

Bartolić, P. (2019). Filogenetski odnosi unutar roda Aurinia Desv. (Brassicaceae) utvrđeni analizom regije ndhF kloroplastne DNA (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:360444

Bartolić, Paolo. "Filogenetski odnosi unutar roda Aurinia Desv. (Brassicaceae) utvrđeni analizom regije ndhF kloroplastne DNA." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:360444

Bartolić, Paolo. "Filogenetski odnosi unutar roda Aurinia Desv. (Brassicaceae) utvrđeni analizom regije ndhF kloroplastne DNA." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:360444

Bartolić, P. (2019). 'Filogenetski odnosi unutar roda Aurinia Desv. (Brassicaceae) utvrđeni analizom regije ndhF kloroplastne DNA', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, accessed 25 November 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:360444

Bartolić P. Filogenetski odnosi unutar roda Aurinia Desv. (Brassicaceae) utvrđeni analizom regije ndhF kloroplastne DNA [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science; 2019 [cited 2024 November 25] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:360444

P. Bartolić, "Filogenetski odnosi unutar roda Aurinia Desv. (Brassicaceae) utvrđeni analizom regije ndhF kloroplastne DNA", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, Zagreb, 2019. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:360444

Metadata
TitleFilogenetski odnosi unutar roda Aurinia Desv. (Brassicaceae) utvrđeni analizom regije ndhF kloroplastne DNA
Title (english)Phylogenetic relationships within genus Aurinia Desv. (Brassicaceae) inferred from chloroplast ndhF sequence data
AuthorPaolo Bartolić
MentorZlatko Liber (mentor)
Committee memberZlatko Liber (predsjednik povjerenstva)
Committee memberBiljana Balen (član povjerenstva)
Committee memberGoran Kovačević (član povjerenstva)
Committee memberTomislav Ivanković (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Science
(Department of Biology)
Zagreb
Defense date and country2019-09-18, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Biology
Abstract
Aurinia Desv. je rod unutar tribusa Alysseae (Brassicaceae) rasprostranjen poglavito na Balkanskom i Apeninskom poluotoku. Vrste roda Aurinia su višegodišnje biljke s pokrovom od zvjezdasto razgranjenih dlaka, listovima rozete izveruganog ili zupčastog ruba, uspravnih stabljika te grozdastim cvatovima sastavljenim od cvjetova isključivo žute boje. Cilj ovog diplomskog rada je bio odrediti srodstvene odnose unutar roda Aurinia usporedbom sekvenci kodirajuće regije ndhF kloroplastne DNA. Iz sakupljenih uzoraka lisnog tkiva, a koji su još na terenu osušeni u vrećicama sa silika-gelom, izolirana je ukupna stanična DNA. Regija ndhF kloroplastne DNA je umnožena lančanom reakcijom polimerazom (PCR), pročišćena i sekvencirana. Filogenetske analize (Bayesovska i metoda maksimalne štedljivosti) i analiza haplotipova potvrdile su monofiliju roda pri čemu su se svi analizirani uzorci grupirali u tri skupine u skladu s geografskim položajem, a ne s dosadašnjom taksonomijom. Vrsta A. saxatilis je bila genetički najraznolikija dok su amfi-jadranske vrste A. leucadea i A. sinuata bile genetički najsrodnije. Grčki endemi, A. gionae i A. moreana, su toliko srodni s vrstom A. saxatilis da ne zaslužuju taksonomski rang zasebnih vrsta. Genetska raznolikost vrsta A. corymbosa i A. petraea ukazuje na to da su one preživjele pleistocenske klimatske oscilacije u više neovisnih mikrorefugija.
Abstract (english)
Aurinia Desv. is a genus within the tribus Alysseae (Brassicaceae), distributed mainly in the Balkan and Apennine Peninsula. Species of this genus are perennial plants with an indumentum of stellate hairs, sinuate or dentate rosette leaves, grooved stems with thickening bases, and raceme inflorescences composed of exclusively yellow flowers. The aim of this thesis was to determine the relationships within the genus Aurinia by comparing the sequences of the ndhF region of chloroplast DNA. Total cellular DNA was isolated from the collected tissue samples, which were dried immediately in the field using plastic bags filled with silica-gel. The ndhF region of chloroplast DNA was amplified by polymerase chain reaction, purified and sequenced. Phylogenetic analyses (Bayesian and Maximum Parsimony methods) and haplotype network confirmed the monophyly of the genus, while all the analysed samples were grouped into three groups according to geographical location, not the current taxonomy. The species A. saxatilis was genetically most diverse, while the amphi-Adriatic species A. leucadea and A. sinuata were genetically the most related. The Greek endemic species, A. moreana and A. gionae, have proven to be so closely related to A. saxatilis that they do not deserve the taxonomic rank of separate species. The genetic diversity of the species A. corymbosa and A. petraea indicated that they survived Pleistocene climate oscillations in multiple independent microrefugia.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:217:360444
Study programmeTitle: Experimental Biology
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra eksperimentalne biologije (magistar/magistra eksperimentalne biologije)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2019-10-23 07:10:57