prikaz prve stranice dokumenta Korelacija filogenije i ontogenije u modelnim biljnim organizmima na temelju indeksa starosti transkriptoma
Access restricted to students and staff of home institution
master's thesis
Korelacija filogenije i ontogenije u modelnim biljnim organizmima na temelju indeksa starosti transkriptoma
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science, 2013. urn:nbn:hr:217:113088
Matejčić, Marija
University of Zagreb
Faculty of Science
Department of Biology

Institutional repository: Repository of the Faculty of Science

Cite this document

Matejčić, M. (2013). Korelacija filogenije i ontogenije u modelnim biljnim organizmima na temelju indeksa starosti transkriptoma (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:113088

Matejčić, Marija. "Korelacija filogenije i ontogenije u modelnim biljnim organizmima na temelju indeksa starosti transkriptoma." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2013. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:113088

Matejčić, Marija. "Korelacija filogenije i ontogenije u modelnim biljnim organizmima na temelju indeksa starosti transkriptoma." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, 2013. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:113088

Matejčić, M. (2013). 'Korelacija filogenije i ontogenije u modelnim biljnim organizmima na temelju indeksa starosti transkriptoma', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, accessed 27 December 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:113088

Matejčić M. Korelacija filogenije i ontogenije u modelnim biljnim organizmima na temelju indeksa starosti transkriptoma [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Science; 2013 [cited 2024 December 27] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:113088

M. Matejčić, "Korelacija filogenije i ontogenije u modelnim biljnim organizmima na temelju indeksa starosti transkriptoma", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Science, Zagreb, 2013. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:113088

Metadata
TitleKorelacija filogenije i ontogenije u modelnim biljnim organizmima na temelju indeksa starosti transkriptoma
Title (english)Transcriptome Age Index Based Phylogeny-Ontogeny Correlation in Model Plant Organisms
AuthorMarija Matejčić
MentorTomislav Domazet-Lošo (mentor)
MentorZlatko Liber (mentor)
Committee memberKristian Vlahoviček (predsjednik povjerenstva)
Committee memberTomislav Domazet-Lošo (član povjerenstva)
Committee memberZlatko Liber (član povjerenstva)
Committee memberDamjan Franjević (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Science
(Department of Biology)
Zagreb
Defense date and country2013-02-14, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Biology
Abstract
Korelacija filogenije i ontogenije već stoljećima okupira biologe. Opisivale su je brojne teorije,uključujući rekapitulacijsku teoriju Ernsta Haeckelai razvojni model pješčanog sata, kao i najnovije istraživanje razvoja zebrice (Danio rerio) koje je bazirano na indeksu starosti transkriptoma (TAI). Ipak, sve su dosadašnje teorije i istraživanja bile usmjerene na razvoj životinja,ostavljajući problem korelacije filogenije i ontogenije u biljaka potpuno neistraženim. Kako bih ispunila ovu prazninu, u ovom radu proučila sam,koristeći filostratigrafsku analizu i TAI, korelaciju filogenije i ontogenije u biljkama Arabidopsis thaliana(dvosupnica)i Zea mays(jednosupnica). Dobiveni rezultati pokazali su da se na početku faze dozrijevanja embrijau obje biljke eksprimiraju evolucijski najstariji geni, oblikujući profil pješčanog sata. Međutim, u kasnijem dijelu ontogenije, u trenutku klijanja vrste Arabidopsis thaliana, primijetila sam ponovni pad vrijednosti TAI-a. Ovaj rezultat ukazuje da su za potpuno razumijevanje korelacija filogenije i ontogenije u biljaka potrebne ekspresijske studije kod predstavnika različitih biljnih koljena koje pokrivaju čitavu ontogeniju.
Abstract (english)
Phylogeny-ontogeny correlation has been in focusofbiologists for more than two centuries. Ernst Haeckel's recapitulation theory, the hourglass model of development,as well as thenewest study of the zebrafish (Danio rerio) development have all studied this correlation on animal embryogenesis. Relations between phylogeny and ontogeny in plants have, however,been completely unexplored. To assess this issue, I studied the phylogeny-ontogeny correlation inplants, a dicot Arabidopsis thaliana anda monocotZea mays, using phylostratigraphic analysisand the transcriptome age index (TAI). The obtained results showed that evolutionary oldest genes are expressedat the onset of the embryo maturation, revealing an hourglass patternin both organisms. However, another decrease in TAI values became apparentlater in the ontogeny, at the stageof Arabidopsis thaliana germination. This resultunderscores that a complete understanding of the phylogeny-ontogeny correlations in plantsrequires new expression datasets that cover complete ontogenies in major plant lineages.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:217:113088
Study programmeTitle: Experimental Biology
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra eksperimentalne biologije (magistar/magistra eksperimentalne biologije)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsAccess restricted to students and staff of home institution
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2017-04-27 10:27:17