prikaz prve stranice dokumenta Identifikacija i bioinformatička analiza Hsp70 gena u genomu alge Nannochloropsis salina CCMP1776
  Download
PDF 12.08 MB
master's thesis
Identifikacija i bioinformatička analiza Hsp70 gena u genomu alge Nannochloropsis salina CCMP1776
Zadar: University of Zadar, 2023. urn:nbn:hr:162:627856
Kopić, David
University of Zadar
Department of Ecology, Agronomy and Aquaculture

Institutional repository: University of Zadar Institutional Repository

Cite this document

Kopić, D. (2023). Identifikacija i bioinformatička analiza Hsp70 gena u genomu alge Nannochloropsis salina CCMP1776 (Master's thesis). Zadar: University of Zadar. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:162:627856

Kopić, David. "Identifikacija i bioinformatička analiza Hsp70 gena u genomu alge Nannochloropsis salina CCMP1776." Master's thesis, University of Zadar, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:162:627856

Kopić, David. "Identifikacija i bioinformatička analiza Hsp70 gena u genomu alge Nannochloropsis salina CCMP1776." Master's thesis, University of Zadar, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:162:627856

Kopić, D. (2023). 'Identifikacija i bioinformatička analiza Hsp70 gena u genomu alge Nannochloropsis salina CCMP1776', Master's thesis, University of Zadar, accessed 30 November 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:162:627856

Kopić D. Identifikacija i bioinformatička analiza Hsp70 gena u genomu alge Nannochloropsis salina CCMP1776 [Master's thesis]. Zadar: University of Zadar; 2023 [cited 2024 November 30] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:162:627856

D. Kopić, "Identifikacija i bioinformatička analiza Hsp70 gena u genomu alge Nannochloropsis salina CCMP1776", Master's thesis, University of Zadar, Zadar, 2023. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:162:627856

Metadata
TitleIdentifikacija i bioinformatička analiza Hsp70 gena u genomu alge Nannochloropsis salina CCMP1776
Title (english)Identification and bioinformatic analysis of the Hsp70 genes in the genome of Nannochloropsis salina CCMP1776
AuthorDavid Kopić
MentorAndrija Finka (mentor)
Committee memberJelena Lončar (predsjednik povjerenstva)
Committee memberSlaven Zjalić (član povjerenstva)
Committee memberAndrija Finka (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zadar
(Department of Ecology, Agronomy and Aquaculture)
Zadar
Defense date and country2023-06-01, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		NATURAL SCIENCES
Biology
Abstract
Globalno zagrijavanje kritičan je problem koji utječe na naš planet i uzrokuje značajne promjene u temperaturi i klimi na Zemlji. Budući da su biljke poikilotermni organizmi, najznačajniji utjecaj globalnog zatopljenja na život biljaka jesu sposobnost kratkotrajne aklimatizacije, kad su temperaturni skokovi značajni i dugotrajna adaptacija na novonastale klimatske uvjete uzrokovane povećanjem temperature. Toplinski stres kritičan je okolišni čimbenik koji može imati ozbiljan utjecaj na rast i razvoj biljaka. Kada su biljke izložene visokim temperaturama tijekom duljeg razdoblja, to može dovesti do širokog spektra fizioloških i biokemijskih promjena, što u konačnici može dovesti do smanjenog rasta i reprodukcije. Jedno od potencijalnih rješenja koja su predložena za ublažavanje utjecaja globalnog zagrijavanja je uporaba algi, posebno vrste mikroalgi Nannochloropsis sp., koje su poznate po svojoj visokoj fotosintetskoj učinkovitosti i stopama rasta. Međutim, globalno zagrijavanje također ima značajne implikacije za alge, uključujući Nannochloropsis sp. čiji molekularni mehanizmi odgovora na stres uključuju aktivaciju kaskade proteina koja u konačnici rezultira sintezom proteina toplinskog udara (Heat shock protein-Hsp). Hsps su grupni naziv za nekoliko različitih evolucijski konzerviranih obitelji proteina od kojih su neki molekularni šaperoni. Hsp70 predstavlja obitelj šaperona čija se koncentracija povećava u stanicama prilikom toplinskog stresa te isti pridonose pravilnom smatanju i stabilizaciji proteina. Bioinformatičkom analizom genoma alge Nannochloropsis sp. utvrdilo se postojanje deset sekvenci proteina iz Hsp70 obitelji i određena su njihova svojstva na temelju fizikalno-kemijskih svojstava, genomskih lokacija, predviđena je stanična lokalizacija pojedinih proteina te su određeni filogenetski odnosi među njima.
Abstract (english)
Global warming is a critical problem that affects our planet and causes significant changes in temperature and climate on Earth. Since plants are poikilothermic organisms, the most significant impacts of global warming on plant life are the ability to acclimate to short-term temperature changes, and long-term adaptation to new climate conditions caused by increased temperature. Heat stress is a critical environmental factor that can have a serious impact on plant growth and development. When plants are exposed to high temperatures for an extended period, it can lead to a wide range of physiological and biochemical changes, ultimately resulting in reduced growth and reproduction. One potential solution proposed to mitigate the impact of global warming is the use of algae, especially the microalga species Nannochloropsis sp., known for their high photosynthetic efficiency and growth rates. However, global warming also has significant implications for algae, including Nannochloropsis sp., whose molecular response mechanisms to stress conditions involve the activation of a protein cascade that ultimately results in the synthesis of heat shock protein (Hsp). Hsps are a group name for several evolutionarily conserved families of proteins, some of which are molecular chaperones. Hsp70 represents a family of chaperones whose concentration increases in cells during heat stress, contributing to proper protein folding and stabilization. Bioinformatic genome analysis of Nannochloropsis sp. algae revealed the existence of ten protein sequences from the Hsp70 family, and their properties were determined based on their physicochemical properties, genomic locations, predicted cellular localization of individual proteins, and their phylogenetic relationships.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:162:627856
Study programmeTitle: Sustainable Management of Aquatic Ecosystems
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra održivog upravljanja vodenim ekosustavima (magistar/magistra održivog upravljanja vodenim ekosustavima)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2023-07-13 11:51:44