prikaz prve stranice dokumenta Metagenomska klasifikacija temeljena na sastavljanju metagenoma
No public access
master's thesis
Metagenomska klasifikacija temeljena na sastavljanju metagenoma
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2023. urn:nbn:hr:168:315769
Frajlić, Nera
University of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing

Institutional repository: FER Repository

Cite this document

Frajlić, N. (2023). Metagenomska klasifikacija temeljena na sastavljanju metagenoma (Master's thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:315769

Frajlić, Nera. "Metagenomska klasifikacija temeljena na sastavljanju metagenoma." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:315769

Frajlić, Nera. "Metagenomska klasifikacija temeljena na sastavljanju metagenoma." Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:315769

Frajlić, N. (2023). 'Metagenomska klasifikacija temeljena na sastavljanju metagenoma', Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, accessed 23 November 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:315769

Frajlić N. Metagenomska klasifikacija temeljena na sastavljanju metagenoma [Master's thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing; 2023 [cited 2024 November 23] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:315769

N. Frajlić, "Metagenomska klasifikacija temeljena na sastavljanju metagenoma", Master's thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, Zagreb, 2023. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:315769

Metadata
TitleMetagenomska klasifikacija temeljena na sastavljanju metagenoma
Title (english)Metagenomic Classification Based on Metagenome Assembly
AuthorNera Frajlić
MentorKrešimir Križanović (mentor)
Committee memberKrešimir Križanović (predsjednik povjerenstva)
Committee memberMarko Subašić (član povjerenstva)
Committee memberMirjana Domazet-Lošo (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing
Zagreb
Defense date and country2023-07-11, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		TECHNICAL SCIENCES
Computing
Abstract
Metagenomika je grana znanosti usmjerena na analizu bakterija, virusa i drugih jednostavnih genoma u metagenomskom uzorku. Metagenomska klasifikacija i određivanje informacija o taksonomskim grupama sekvenci u uzorku pojavljuje s kao koristan alat u metagenomskoj analizi. Genomika uvodi metode za manipuliranje genomskim podacima, uključujući algoritme poravnanja i mapiranja, alate za sastavljanje genoma i drugo, koji su korisni pri provođenju metagenomske klasifikacije. Ovaj diplomski rad pruža pregled područja metagenomske klasifikacije i usmjeren je na istraživanje metode za poboljšanje metagenomske klasifikacije korištenjem sastavljenih kontiga generiranih iz simuliranog uzorka ciljnih sekvenci. U analizi je sudjelovalo nekoliko uzoraka podataka koji sadrže određene anomalije i nekoliko baza podataka.
Abstract (english)
Metagenomics research specializes in the analysis of bacterial, viral, and other genomes present in metagenomic samples. A key aspect of metagenomic analysis is classifying and understanding taxonomic information within a sample. Various methods for handling genomic data exist, such as mapping and alignment algorithms, assembly tools, and more, which prove beneficial in metagenomic classification. This thesis focuses on investigating specific approaches to improve metagenomic classification using assembly contigs derived from simulated samples of target sequences. By exploring this method, this research should contribute to the further development of metagenomic analysis technology. Multiple samples were tested with different true-to-life results, each containing specific anomalies that are likely to be encountered in a real-world environment.
Keywords
Keywords (english)
Languageenglish
URN:NBNurn:nbn:hr:168:315769
Study programmeTitle: Computing
Study programme type: university
Study level: graduate
Academic / professional title: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsClosed access
Terms of useLicence In copyright icon
Public note
Created on2023-10-11 08:51:16