prikaz prve stranice dokumenta Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona
No public access
undergraduate thesis
Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona
Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2019. urn:nbn:hr:168:811843
Milisavljević, Alexandra
University of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing

Institutional repository: FER Repository

Cite this document

Milisavljević, A. (2019). Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona (Undergraduate thesis). Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

Milisavljević, Alexandra. "Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona." Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

Milisavljević, Alexandra. "Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona." Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

Milisavljević, A. (2019). 'Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona', Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, accessed 28 December 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

Milisavljević A. Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona [Undergraduate thesis]. Zagreb: University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing; 2019 [cited 2024 December 28] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

A. Milisavljević, "Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona", Undergraduate thesis, University of Zagreb, Faculty of Electrical Engineering and Computing, Zagreb, 2019. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

Metadata
TitleIzgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona
Title (english)Phylogenetic Tree Construction using Maximum Parsimony and Maximum Likelihood
AuthorAlexandra Milisavljević
MentorMirjana Domazet-Lošo (mentor)
Committee memberMirjana Domazet-Lošo (predsjednik povjerenstva)
Committee memberLjiljana Brkić (član povjerenstva)
Committee memberIvica Botički (član povjerenstva)
GranterUniversity of Zagreb
Faculty of Electrical Engineering and Computing
Zagreb
Defense date and country2019-07-12, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		TECHNICAL SCIENCES
Computing
Abstract
Metode izgradnje filogenetskog stabla temeljene na obilježjima taksona određuju međusobne odnose taksona, odnosno vrsta, promatrajući njihove morfološke ili molekularne razlike. Te metode daju preciznije rezultate od metoda temeljenih na udaljenostima taksona. Metoda najmanjeg broja evolucijskih promjena se vodi načelom Occamove oštrice, odnosno stablo koje zahtijeva najmanje promjena je najvjerojatnije da će se dogoditi. Druga metoda je metoda najveće izglednosti koja se temelji na probabilističkom modelu evolucije. Dodajući jedan po jedan takson u stablo se određuje koja topologija stabla je najizglednija. Nakon implementacije algoritama provedeno je testiranje na genomu virusa HIV-1 te su dobiveni rezultati uspoređeni s rezultatima već postojećih alata.
Abstract (english)
Characters based methods determine relations between taxons by evaluating their morphological or molecular differences. These methods give far better results than distance based methods. Maximum parsimony method follows the principle of Occam's razor, the tree that requires the least amount of changes is the most probable tree. The other method, maximum likelihood, is based on a probabilistic model of evolution. By adding taxons to the tree one by one, after each addition the most likely tree topology is recalculated. After the implementation of proposed algorithms, the tests were conducted using the genome of virus HIV-1, and the results were compared with ones gotten from existing phylogenetic tools.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:168:811843
Study programmeTitle: Computing
Study programme type: university
Study level: undergraduate
Academic / professional title: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsClosed access
Terms of useLicence In copyright icon
Public note
Created on2020-01-07 20:31:39