prikaz prve stranice dokumenta Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona
Rad nije dostupan
završni rad
Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2019. urn:nbn:hr:168:811843
Milisavljević, Alexandra
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Milisavljević, A. (2019). Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona (Završni rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

Milisavljević, Alexandra. "Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

Milisavljević, Alexandra. "Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

Milisavljević, A. (2019). 'Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona', Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 30.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

Milisavljević A. Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona [Završni rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2019 [pristupljeno 30.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

A. Milisavljević, "Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona", Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2019. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:811843
Podaci o radu
NaslovIzgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona
Naslov (engleski)Phylogenetic Tree Construction using Maximum Parsimony and Maximum Likelihood
AutorAlexandra Milisavljević
MentorMirjana Domazet-Lošo (mentor)
Član povjerenstvaMirjana Domazet-Lošo (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaLjiljana Brkić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIvica Botički (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2019-07-12, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
Metode izgradnje filogenetskog stabla temeljene na obilježjima taksona određuju međusobne odnose taksona, odnosno vrsta, promatrajući njihove morfološke ili molekularne razlike. Te metode daju preciznije rezultate od metoda temeljenih na udaljenostima taksona. Metoda najmanjeg broja evolucijskih promjena se vodi načelom Occamove oštrice, odnosno stablo koje zahtijeva najmanje promjena je najvjerojatnije da će se dogoditi. Druga metoda je metoda najveće izglednosti koja se temelji na probabilističkom modelu evolucije. Dodajući jedan po jedan takson u stablo se određuje koja topologija stabla je najizglednija. Nakon implementacije algoritama provedeno je testiranje na genomu virusa HIV-1 te su dobiveni rezultati uspoređeni s rezultatima već postojećih alata.
Sažetak (engleski)
Characters based methods determine relations between taxons by evaluating their morphological or molecular differences. These methods give far better results than distance based methods. Maximum parsimony method follows the principle of Occam's razor, the tree that requires the least amount of changes is the most probable tree. The other method, maximum likelihood, is based on a probabilistic model of evolution. By adding taxons to the tree one by one, after each addition the most likely tree topology is recalculated. After the implementation of proposed algorithms, the tests were conducted using the genome of virus HIV-1, and the results were compared with ones gotten from existing phylogenetic tools.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:811843
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: preddiplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (univ.bacc.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2020-01-07 20:31:39