prikaz prve stranice dokumenta Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme
  Download
PDF 2.26 MB
doctoral thesis
Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme
Split: University of Split, School of Medicine, 2009. urn:nbn:hr:171:569951
Goić Barišić, Ivana
University of Split
School of Medicine

Institutional repository: MEFST Repository

Cite this document

Goić Barišić, I. (2009). Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme (Doctoral thesis). Split: University of Split, School of Medicine. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

Goić Barišić, Ivana. "Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme." Doctoral thesis, University of Split, School of Medicine, 2009. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

Goić Barišić, Ivana. "Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme." Doctoral thesis, University of Split, School of Medicine, 2009. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

Goić Barišić, I. (2009). 'Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme', Doctoral thesis, University of Split, School of Medicine, accessed 22 November 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

Goić Barišić I. Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme [Doctoral thesis]. Split: University of Split, School of Medicine; 2009 [cited 2024 November 22] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

I. Goić Barišić, "Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme", Doctoral thesis, University of Split, School of Medicine, Split, 2009. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

Metadata
TitleMolekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme
Title (english)Molecular basis of reduced susceptibility of clinical isolates of Acinetobacter baumannii species to carbapenems
AuthorIvana Goić Barišić
MentorBranka Bedenić (mentor)
Committee memberVolga Punda Polić (predsjednik povjerenstva)
Committee memberNikola Bradarić (član povjerenstva)
Committee memberIrena Drmić-Hofman (član povjerenstva)
Committee memberJugoslav Bagatin (član povjerenstva)
Committee memberMladen Boban (član povjerenstva)
GranterUniversity of Split
School of Medicine
Split
Defense date and country2009, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		BIOMEDICINE AND HEALTHCARE
Clinical Medical Sciences
Infectology
Universal decimal classification
(UDC)		616 - Pathology. Clinical medicine
Abstract
Tijekom šestogodišnjeg razdoblja istraživanja (2002.-2007.) prikupljeno je 106 izolata A. baumannii sa smanjenom osjetljivošću na jedan ili oba karbapenema s različitih odjela i jedinica intenzivnog liječenja unutar KBC Split. Osjetljivost na antibiotike određena je disk-difuzijskom metodom i potvrđena mikrodilucijom u bujonu prema standardima CLSI. Kod svih izolata A. baumannii nađena je osjetljivost ili rezistencija na imipenem (MIK 2- 32 µg/ml), te umjerena osjetljivost ili rezistencija na meropenem (MIK 8-128 µg/ml) s višim vrijednostima MIK-a za meropenem. Svi izolati uključeni u izradu disertacije bili su rezistentni ili umjereno osjetljivi na sve druge skupine antibiotika osim ampicilin/sulbaktam. Prisustvo blaOXA gena istraženo je lančanom reakcijom polimeraze (PCR). Genotipizacijom izolata metodom elektroforeze u pulzirajućem polju (PFGE) istražena je sličnost među izolatima. PCR produkti blaOXA-51 like gena sekvencionirani su za šest odabranih reprezentativnih izolata. Lančanom reakcijom polimeraze dokazano je prisustvo blaOXA-51 enzima u svim prikupljenim izolatima. Nisu pronađene OXA-23 i OXA-24 β-laktamaze, kao ni na plazmidu smješteni blaOXA-58 gen. Rezultati sekvencioniranja potvrdili su prisustvo novog enzima OXA-107 u šest reprezentativnih izolata s različitih odjela KBC Split. Kod većine izolata (100/106) sa smanjenom osjetljivošću na jedan ili oba karbapenema otkrivena je insercijska sekvencija ISAba1 smještena neposredno uz blaOXA-51 gen. Rezultati genotipizacije potvrdili su klonsku sličnost na razini 80 % među svim prikupljenim izolatima, te tri genotipa (A, B, C) unutar KBC Split. Genotip A je najzastupljeniji, proširen je unutar različitih odjela i jedinica intenzivne njege u KBC Split, te posjeduje najveći epidemijski potencijal. Racionalnija primjena karbapenemskih antibiotika u odnosu na prethodne godine i uvođenje probira na karbapenem rezistentne izolate A. baumannii, zasigurno bi pridonijeli ograničavanju širenja ovog multiplo rezistentnog patogena i manjem broju bolničkih infekcija.
Abstract (english)
In total, 106 carbapenem resistant isolates of Acinetobacter baumannii were obtained from different intensive care units inside University Hospital of Split, Croatia, during six years (2002-2007) study period. The susceptibility to a wide range of antibiotics was determined by disc-diffusion and broth microdilution method according to CLSI. All isolates of A. baumannii displayed susceptible or resistant profile to imipenem (MICs 2-32 mg/L) and intermediate or resistant profile to meropenem (MICs 8-128 mg/L) with higher MICs values to meropenem. Susceptibility testing found all isolates to be resistant to all tested antibiotics except of ampicillin/sulbactam. BlaOXA genes were detected by PCR using conditions and protocols as described previously. Genetic relatedness of the isolates was determined by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). Amplicons of the selected representative strains were subjected to sequencing of blaOXA-genes. In present study we found OXA-51 group of oxacillinases in all tested isolates by PCR. No other class D oxacillinases (OXA-23-like, OXA-24-like or OXA-58-like) were detected by PCR. Sequencing data confirmed presence of new OXA-107 enzyme in six representative strains. The most of isolates with carbapenem resistance profile (100/106) were found to possess ISAba1 insertion sequence located upstream of blaOXA-51 gene. According to PFGE all isolates were clonally related with similarity cut-off value of 80% and were assigned into three PFGE clusters (A, B, C). Cluster A was representative with the largest epidemic potential and distended inside different departments and intensive care units in Split University Hospital. Changes in antibiotic policy are recommended to reduce selection pressure which favors spread of carbapenem resistant A. baumanii isolates in the hospital environment. Furthermore, the factors responsible for dissemination of such strains need to be identified, controlled and prevented to avoid major outbreaks.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:171:569951
Study programmeTitle: Basic and clinical medical sciences
Study programme type: university
Study level: postgraduate
Academic / professional title: doktor/doktorica znanosti, područje biomedicine i zdravstva, polje kliničke medicinske znanosti (doktor/doktorica znanosti, područje biomedicine i zdravstva, polje kliničke medicinske znanosti)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2024-04-08 10:16:04