prikaz prve stranice dokumenta Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme
  Preuzmi
PDF 2.26 MB
disertacija
Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme
Split: Sveučilište u Splitu, Medicinski fakultet, 2009. urn:nbn:hr:171:569951
Goić Barišić, Ivana
Sveučilište u Splitu
Medicinski fakultet

Institucijski repozitorij: Repozitorij MEFST

Citirajte ovaj rad

Goić Barišić, I. (2009). Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme (Disertacija). Split: Sveučilište u Splitu, Medicinski fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

Goić Barišić, Ivana. "Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme." Disertacija, Sveučilište u Splitu, Medicinski fakultet, 2009. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

Goić Barišić, Ivana. "Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme." Disertacija, Sveučilište u Splitu, Medicinski fakultet, 2009. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

Goić Barišić, I. (2009). 'Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme', Disertacija, Sveučilište u Splitu, Medicinski fakultet, citirano: 26.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

Goić Barišić I. Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme [Disertacija]. Split: Sveučilište u Splitu, Medicinski fakultet; 2009 [pristupljeno 26.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

I. Goić Barišić, "Molekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme", Disertacija, Sveučilište u Splitu, Medicinski fakultet, Split, 2009. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:171:569951
Podaci o radu
NaslovMolekularna osnova smanjene osjetljivosti kliničkih izolata vrste Acinetobacter baumannii na karbapeneme
Naslov (engleski)Molecular basis of reduced susceptibility of clinical isolates of Acinetobacter baumannii species to carbapenems
AutorIvana Goić Barišić
MentorBranka Bedenić (mentor)
Član povjerenstvaVolga Punda Polić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaNikola Bradarić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIrena Drmić-Hofman (član povjerenstva)
Član povjerenstvaJugoslav Bagatin (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMladen Boban (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Splitu
Medicinski fakultet
Split
Datum i država obrane2009, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO
Kliničke medicinske znanosti
Infektologija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		616 - Patologija. Klinička medicina
Sažetak
Tijekom šestogodišnjeg razdoblja istraživanja (2002.-2007.) prikupljeno je 106 izolata A. baumannii sa smanjenom osjetljivošću na jedan ili oba karbapenema s različitih odjela i jedinica intenzivnog liječenja unutar KBC Split. Osjetljivost na antibiotike određena je disk-difuzijskom metodom i potvrđena mikrodilucijom u bujonu prema standardima CLSI. Kod svih izolata A. baumannii nađena je osjetljivost ili rezistencija na imipenem (MIK 2- 32 µg/ml), te umjerena osjetljivost ili rezistencija na meropenem (MIK 8-128 µg/ml) s višim vrijednostima MIK-a za meropenem. Svi izolati uključeni u izradu disertacije bili su rezistentni ili umjereno osjetljivi na sve druge skupine antibiotika osim ampicilin/sulbaktam. Prisustvo blaOXA gena istraženo je lančanom reakcijom polimeraze (PCR). Genotipizacijom izolata metodom elektroforeze u pulzirajućem polju (PFGE) istražena je sličnost među izolatima. PCR produkti blaOXA-51 like gena sekvencionirani su za šest odabranih reprezentativnih izolata. Lančanom reakcijom polimeraze dokazano je prisustvo blaOXA-51 enzima u svim prikupljenim izolatima. Nisu pronađene OXA-23 i OXA-24 β-laktamaze, kao ni na plazmidu smješteni blaOXA-58 gen. Rezultati sekvencioniranja potvrdili su prisustvo novog enzima OXA-107 u šest reprezentativnih izolata s različitih odjela KBC Split. Kod većine izolata (100/106) sa smanjenom osjetljivošću na jedan ili oba karbapenema otkrivena je insercijska sekvencija ISAba1 smještena neposredno uz blaOXA-51 gen. Rezultati genotipizacije potvrdili su klonsku sličnost na razini 80 % među svim prikupljenim izolatima, te tri genotipa (A, B, C) unutar KBC Split. Genotip A je najzastupljeniji, proširen je unutar različitih odjela i jedinica intenzivne njege u KBC Split, te posjeduje najveći epidemijski potencijal. Racionalnija primjena karbapenemskih antibiotika u odnosu na prethodne godine i uvođenje probira na karbapenem rezistentne izolate A. baumannii, zasigurno bi pridonijeli ograničavanju širenja ovog multiplo rezistentnog patogena i manjem broju bolničkih infekcija.
Sažetak (engleski)
In total, 106 carbapenem resistant isolates of Acinetobacter baumannii were obtained from different intensive care units inside University Hospital of Split, Croatia, during six years (2002-2007) study period. The susceptibility to a wide range of antibiotics was determined by disc-diffusion and broth microdilution method according to CLSI. All isolates of A. baumannii displayed susceptible or resistant profile to imipenem (MICs 2-32 mg/L) and intermediate or resistant profile to meropenem (MICs 8-128 mg/L) with higher MICs values to meropenem. Susceptibility testing found all isolates to be resistant to all tested antibiotics except of ampicillin/sulbactam. BlaOXA genes were detected by PCR using conditions and protocols as described previously. Genetic relatedness of the isolates was determined by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). Amplicons of the selected representative strains were subjected to sequencing of blaOXA-genes. In present study we found OXA-51 group of oxacillinases in all tested isolates by PCR. No other class D oxacillinases (OXA-23-like, OXA-24-like or OXA-58-like) were detected by PCR. Sequencing data confirmed presence of new OXA-107 enzyme in six representative strains. The most of isolates with carbapenem resistance profile (100/106) were found to possess ISAba1 insertion sequence located upstream of blaOXA-51 gene. According to PFGE all isolates were clonally related with similarity cut-off value of 80% and were assigned into three PFGE clusters (A, B, C). Cluster A was representative with the largest epidemic potential and distended inside different departments and intensive care units in Split University Hospital. Changes in antibiotic policy are recommended to reduce selection pressure which favors spread of carbapenem resistant A. baumanii isolates in the hospital environment. Furthermore, the factors responsible for dissemination of such strains need to be identified, controlled and prevented to avoid major outbreaks.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:171:569951
Studijski programNaziv: Temeljne i kliničke medicinske znanosti
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: poslijediplomski znanstveni (doktorski)
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje biomedicine i zdravstva, polje kliničke medicinske znanosti (dr. sc.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2024-04-08 10:16:04