prikaz prve stranice dokumenta Vizualizacija "Runs of Homozygosity" DNA segmenata
  Preuzmi
PDF 921.85 KB
diplomski rad
Vizualizacija "Runs of Homozygosity" DNA segmenata
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2018. urn:nbn:hr:204:059070
Hrženjak, Marko
Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
Opće stočarstvo

Institucijski repozitorij: Repozitorij Agronomskog fakulteta u Zagrebu

Citirajte ovaj rad

Hrženjak, M. (2018). Vizualizacija "Runs of Homozygosity" DNA segmenata (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:059070

Hrženjak, Marko. "Vizualizacija "Runs of Homozygosity" DNA segmenata." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:059070

Hrženjak, Marko. "Vizualizacija "Runs of Homozygosity" DNA segmenata." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:059070

Hrženjak, M. (2018). 'Vizualizacija "Runs of Homozygosity" DNA segmenata', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, citirano: 25.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:059070

Hrženjak M. Vizualizacija "Runs of Homozygosity" DNA segmenata [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet; 2018 [pristupljeno 25.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:059070

M. Hrženjak, "Vizualizacija "Runs of Homozygosity" DNA segmenata", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, Zagreb, 2018. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:059070

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:059070
Podaci o radu
NaslovVizualizacija "Runs of Homozygosity" DNA segmenata
Naslov (engleski)Visualization of "Runs of Homozygosity" segment
AutorMarko Hrženjak
MentorMaja Ferenčaković (mentor)
Član povjerenstvaMaja Ferenčaković (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaIno Čurik (član povjerenstva)
Član povjerenstvaVlatka Čubrić Čurik (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
(Opće stočarstvo)
Zagreb
Datum i država obrane2018-09-21, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOTEHNIČKE ZNANOSTI
Poljoprivreda (agronomija)
Sažetak
„Runs of homozygosity” su segmenti/cijele genomske regije gdje se identični haplotipovi nasljeđuju od svakoga roditelja. Od njihovog otkrića zbog tehnološkog napretka u 90-ima, „Runs of homozygosity” su otkrili podosta o podrijetlu genoma jedinke, dešifrirajući genetsku bazu monogenskih i kompleksnih svojstava i bolesti. Kako tehnologija napreduje tako se i povećava zahtjev za novim metodama analize SNP podataka. Mapiranje ROH se može provesti kroz više načina i svaki ima svoje prednosti i mane. U ovom radu će se predstaviti metoda analiziranja, čišćenja i vizualni prikaz kao krajnji rezultat u Pythonu.
Sažetak (engleski)
"Runs of homozygosity" are segments or whole genomic regions where the identical haplotypes are inherited from each parent. Since their discovery because of the technological advances in late 90s, "Runs of homozygosity" shed some light on about individual genome origin, decoding the genetic base of monogenic and complex traits and diseases. As technology progresses, a demand for new methods of analysis of SNP data rise as well. Mapping of ROH segments can be performed in many was and every method has its own strengths and flaws. In this paper a method will be shown for analysis, data cleaning, and visual representation as a result in Python.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:204:059070
Studijski programNaziv: Genetika i oplemenjivanje životinja
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/ magistra inženjer/inženjerka genetike i oplemenjivanja životinja (mag. ing. agr.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2018-10-15 07:38:16