prikaz prve stranice dokumenta Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca
  Preuzmi
PDF 1.7 MB
diplomski rad
Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2021. urn:nbn:hr:204:179823
Shihabi, Mario
Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
Opće stočarstvo

Institucijski repozitorij: Repozitorij Agronomskog fakulteta u Zagrebu

Citirajte ovaj rad

Shihabi, M. (2021). Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:179823

Shihabi, Mario. "Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:179823

Shihabi, Mario. "Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:179823

Shihabi, M. (2021). 'Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, citirano: 28.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:179823

Shihabi M. Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet; 2021 [pristupljeno 28.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:179823

M. Shihabi, "Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, Zagreb, 2021. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:179823

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:179823
Podaci o radu
NaslovIdentifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca
Naslov (engleski)Detection of positive selection signatures in the genome of Croatian sheep
AutorMario Shihabi
MentorIno Čurik (mentor)
Član povjerenstvaIno Čurik (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaVlatka Čubrić Čurik (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMaja Ferenčaković (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
(Opće stočarstvo)
Zagreb
Datum i država obrane2021-07-12, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOTEHNIČKE ZNANOSTI
Poljoprivreda (agronomija)
Sažetak
Ovčarstvo je jedan od najvažnijih stočarskih sektora u mediteranskom području Hrvatske odakle potječe većina hrvatskih autohtonih pasmina. Prisutni signali pozitivne selekcije posljedica su adaptacije na oskudne okolišne čimbenike, ali i odabira (selekcije) ljudi. U ovom istraživanju je uz autosome bio uključen i spolni kromosom X (kod ženskih jedinki), zbog utjecaja spolno vezanog nasljeđivanja na ekonomski i evolucijski važna svojstva. Cilj rada bio je identificirati signale pozitivne selekcije putem dvije metode, iHS i eROHi, koristeći uzorak veličine 102 jedinke iz 4 autohtone pasmine ovaca Hrvatske i 606 006 SNP-ova (Infinium® HD SNP BeadChip), na kojem je prije analize obavljena kontrola kvalitete. Obje metode temelje se na analizi genomskih varijacija unutar jedne velike metapopulacije, koja ovdje predstavlja hrvatske autohtone pasmine ovaca. Uočeni su mnogi ekonomski i evolucijski važni geni te je tako razjašnjena prisutnost pojedinih signala u populaciji. Za precizniju i pouzdaniju analizu potrebno je povećati uzorak te uključiti još metoda identifikacije.
Sažetak (engleski)
Sheep farming is one of the most important livestock sectors in the Mediterranean region of Croatia, where most of the Croatian autochthonous breeds originate from. The present positive selection signatures are a consequence of adaptation to scarce environmental factors, but also of artificial selection. In addition to autosomes, sex chromosome X (in females) was included in this study because of the known influence of sex-linked inheritance on many economically and evolutionarily important traits. The aim of this study was to identify positive selection signatures by two methods, iHS and eROHi, using a sample size of 102 individuals from 4 Croatian autochthonous breeds and 606 006 SNPs (Infinium® HD SNP BeadChip) on which quality control was performed before analysis. Both methods are based on the analysis of genomic variation within a large metapopulation, which here represents Croatian autochthonous sheep breeds. Many economically and evolutionarily relevant genes were identified, highlighting the presence of multiple signatures in the population. For a more accurate and reliable analysis, it is necessary to increase the sample size and include additional identification methods.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:204:179823
Studijski programNaziv: Genetika i oplemenjivanje životinja
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/ magistra inženjer/inženjerka genetike i oplemenjivanja životinja (mag. ing. agr.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2021-10-07 11:27:29