prikaz prve stranice dokumenta Alat za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem
Rad nije dostupan
diplomski rad
Alat za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2014. urn:nbn:hr:168:238102
Jerković, Igor
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Jerković, I. (2014). Alat za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:238102

Jerković, Igor. "Alat za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2014. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:238102

Jerković, Igor. "Alat za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2014. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:238102

Jerković, I. (2014). 'Alat za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 07.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:238102

Jerković I. Alat za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2014 [pristupljeno 07.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:238102

I. Jerković, "Alat za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2014. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:238102

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:238102
Podaci o radu
NaslovAlat za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem
Naslov (engleski)RNA-seq mapper
AutorIgor Jerković
MentorMile Šikić (mentor)
Član povjerenstvaMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMladen Vučić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaDamir Seršić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2014-07-07, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
RNA sekvenciranje je metoda za analizu transkriptoma. Razumijevanje transkriptoma je izuzetno važno iz nekoliko razloga kao što su shvaćanje funkcionalnih elemenata genoma i razumijevanje razvoja pojedinih bolesti, što je samo par od mnogih mogućnosti primjene. Ovaj rad prikazuje novi algoritam za mapiranje podataka dobivenih RNA sekvenciranjem, posebice za očitanja koja se prostiru preko više eksoma. Usporedba sa trenutno najhvaljenijim i najboljim sličnim alatima kao što su Tophat i BBMap prikazana je u radu.
Sažetak (engleski)
RNA sequencing is a method for transcriptome analysis. Understanding the transcriptome is essential for various reasons such as interpreting the functional elements of the genome and undrestanding development of diseases, among many other use cases. This thesis presents a new RNA-seq spliced alignment algorithm, that uses finding the longest increasing subsequence in detecting splice sites and mapping spliced reads across exon junctions. Comparison between some of the state-of-the-art tools such as Tophat and BBMap are given.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:238102
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2018-02-06 09:26:46