prikaz prve stranice dokumenta Klasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera
Rad nije dostupan
završni rad
Klasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2024. urn:nbn:hr:168:704735
Vuković, Franjo
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Vuković, F. (2024). Klasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera (Završni rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:704735

Vuković, Franjo. "Klasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:704735

Vuković, Franjo. "Klasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:704735

Vuković, F. (2024). 'Klasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera', Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 25.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:704735

Vuković F. Klasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera [Završni rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2024 [pristupljeno 25.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:704735

F. Vuković, "Klasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera", Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2024. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:704735

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:704735
Podaci o radu
NaslovKlasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera
Naslov (engleski)K-mer-Based Classification of Parental Origin of Genetic Sequences
AutorFranjo Vuković
MentorMile Šikić (mentor)
Član povjerenstvaMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaJosipa Lipovac (član povjerenstva)
Član povjerenstvaFilip Tomas (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2024-07-02, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
U ovom radu istražuje se klasifikacija roditeljskog porijekla genetskih sekvenci pomoću k-mera. Proces genetskog nasljeđivanja uključuje nasumičan prijenos genetskog materijala od roditelja na potomke, pri čemu nastaju mutacije koje stvaraju nove karakteristike. Za diploidne organizme, svaki kromosom u paru nasljeđuje genetski materijal od jednog roditelja. Cilj ovog rada je pomoću postojećih algoritama implementirati metodu koja će klasificirati genetske sekvence potomka kao majčinske ili očinske. Algoritam koristi k-mere, podnizove određene duljine, specifične za svakog roditelja, kako bi klasificirao očitanja potomka kao majčinska ili očinska. Metode i algoritmi su implementirani i testirani na nekoliko skupova podataka, uključujući genom bakterije Escherichia coli i ljudske genome, pri čemu su analizirani rezultati i učinkovitost.
Sažetak (engleski)
This paper investigates the classification of parental origin of genetic sequences using k-mers. The process of genetic inheritance involves the random transfer of genetic material from parents to offspring, during which mutations occur that create new characteristics. For diploid organisms, each chromosome in a pair inherits genetic material from one parent. The aim of this paper is to implement a method using existing algorithms that will classify the genetic sequences of the offspring as maternal or paternal. The algorithm uses k-mers, subsequences of a specified length, specific to each parent, to classify the offspring's reads as maternal or paternal. Methods and algorithms have been implemented and tested on several data sets, including the genome of the bacterium Escherichia coli and human genomes, analyzing the results and efficiency.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:704735
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: preddiplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (univ.bacc.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2024-10-12 22:29:43