prikaz prve stranice dokumenta Poravnanje RNA očitanja na poznate gene
Rad nije dostupan
završni rad
Poravnanje RNA očitanja na poznate gene
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2016. urn:nbn:hr:168:396403
Krpelnik, Ivan
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Krpelnik, I. (2016). Poravnanje RNA očitanja na poznate gene (Završni rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:396403

Krpelnik, Ivan. "Poravnanje RNA očitanja na poznate gene." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:396403

Krpelnik, Ivan. "Poravnanje RNA očitanja na poznate gene." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:396403

Krpelnik, I. (2016). 'Poravnanje RNA očitanja na poznate gene', Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 26.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:396403

Krpelnik I. Poravnanje RNA očitanja na poznate gene [Završni rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2016 [pristupljeno 26.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:396403

I. Krpelnik, "Poravnanje RNA očitanja na poznate gene", Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2016. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:396403

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:396403
Podaci o radu
NaslovPoravnanje RNA očitanja na poznate gene
Naslov (engleski)RNA-seq alignment using existing gene anotation
AutorIvan Krpelnik
MentorMile Šikić (mentor)
Član povjerenstvaMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaKrešimir Križanović (član povjerenstva)
Član povjerenstvaRobert Vaser (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2016-07-11, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
RNA sekvenciranje je metoda za analizu transkriptoma. Analizom transkriptoma u nekom trenutku dobivamo uvid u stanje organizma i mogućnost identificiranja regija genoma koje su odgovorne za različite funkcije. U ovom radu je prikazano proširenje alata u svrhu poravnanja RNA očitanja na poznate gene. Osim toga, opisani su osnovni mehanizmi u sekvenciranju nanoporama, te neke druge tehnologije korištene za sekvenciranje i poravnanje. Dan je i pregled formata datoteka koje su korištene za spremanje anotacija eksonski regija, spremanje genoma i transkriptoma i spremanje podataka o poravnanjima.
Sažetak (engleski)
RNA sequencing is a method used for transcriptome analysis. Transcriptome analysis provides us with insight into the state of cells. There is a possibility of identifying regions of a genome in order to determine which regions are responsible for which functions and which regions are active in a state of disease. This thesis describes an upgrade to alignment tool that should make alignment of RNA reads using existing gene annotation possible. Besides the mentioned upgrade, thesis describes different technologies used in sequencing, other alignment tools and file formats used to store information about genome and transcriptome.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:396403
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: preddiplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (univ.bacc.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2018-02-06 09:57:22