prikaz prve stranice dokumenta Određivanje patogenih vrsta iz RNA sekvenciranih podataka
Rad nije dostupan
diplomski rad
Određivanje patogenih vrsta iz RNA sekvenciranih podataka
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2014. urn:nbn:hr:168:613464
Šošić, Matija
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Šošić, M. (2014). Određivanje patogenih vrsta iz RNA sekvenciranih podataka (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:613464

Šošić, Matija. "Određivanje patogenih vrsta iz RNA sekvenciranih podataka." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2014. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:613464

Šošić, Matija. "Određivanje patogenih vrsta iz RNA sekvenciranih podataka." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2014. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:613464

Šošić, M. (2014). 'Određivanje patogenih vrsta iz RNA sekvenciranih podataka', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 09.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:613464

Šošić M. Određivanje patogenih vrsta iz RNA sekvenciranih podataka [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2014 [pristupljeno 09.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:613464

M. Šošić, "Određivanje patogenih vrsta iz RNA sekvenciranih podataka", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2014. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:613464

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:613464
Podaci o radu
NaslovOdređivanje patogenih vrsta iz RNA sekvenciranih podataka
Naslov (engleski)Identify pathogen organisms from a stream of RNA sequences
AutorMatija Šošić
MentorMile Šikić (mentor)
Član povjerenstvaMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMladen Vučić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaDamir Seršić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2014-07-07, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
Metagenomika je zanimljivo novo znanstveno područje čiji je zadatak karakterizacija mikroskopskih zajednica živih organizama. Posebna važnost je u tome što većina mikroorganizama ne može biti uzgojena u laboratoriju, stoga nam metagenomika otkriva mnoge nepoznate vrste. Ovaj rad predstavlja taksonomski ovisnu i na poravnanju sekvenci na referentni genom temeljenu metodu za određivanje vrsta prisutnih u danom metagenomskom uzorku. Pristup se temelji na identifikaciji i analizi ribosomskih kodirajućih sekvenci za koje se smatra da su indikatori prisutnih vrsta. Rješenje radi s RNA sekvenciranim podacima i testirano je na stvarnom uzorku iz prirodnog okruženja.
Sažetak (engleski)
Metagenomics is an interesting new field of science focused on characterization of microbial communities from environmental samples. It is especially important as many organisms cannot be cultivated in a laboratory and therefore can reveal previously unknown species. This thesis presents a taxonomy-dependent and alignment-based method for determining species present in a given metagenomic sample. Main premise is identification and analysis of ribosomal coding sequences which are considered to be indicators of presence of organisms. The solution works with RNA-seq data and is tested on a real dataset from an environmental sample.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:613464
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2018-02-06 12:21:50