prikaz prve stranice dokumenta Primjena skrivenih Markovljevih modela za pretraživanje nukleotidnih sljedova
Rad nije dostupan
završni rad
Primjena skrivenih Markovljevih modela za pretraživanje nukleotidnih sljedova
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2017. urn:nbn:hr:168:518474
Medvidović, Krešimir
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Medvidović, K. (2017). Primjena skrivenih Markovljevih modela za pretraživanje nukleotidnih sljedova (Završni rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:518474

Medvidović, Krešimir. "Primjena skrivenih Markovljevih modela za pretraživanje nukleotidnih sljedova." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:518474

Medvidović, Krešimir. "Primjena skrivenih Markovljevih modela za pretraživanje nukleotidnih sljedova." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:518474

Medvidović, K. (2017). 'Primjena skrivenih Markovljevih modela za pretraživanje nukleotidnih sljedova', Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 30.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:518474

Medvidović K. Primjena skrivenih Markovljevih modela za pretraživanje nukleotidnih sljedova [Završni rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2017 [pristupljeno 30.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:518474

K. Medvidović, "Primjena skrivenih Markovljevih modela za pretraživanje nukleotidnih sljedova", Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2017. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:518474

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:518474
Podaci o radu
NaslovPrimjena skrivenih Markovljevih modela za pretraživanje nukleotidnih sljedova
Naslov (engleski)Application of Hidden Markov Models for Searching Nucleotide Sequences
AutorKrešimir Medvidović
MentorMirjana Domazet-Lošo (mentor)
Član povjerenstvaMirjana Domazet-Lošo (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDamir Kalpić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIgor Mekterović (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2017-07-10, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
U ovom radu sam se pobliže upoznao s Markovljevim modelima i njihovom primjenom u bioinformatici. Nakon definiranja CpG otoka i skrivenih Markovljevih modela primjenio sam Viterbijev algoritam za pretragu CpG otoka u danom slijedu. Implementaciju sam napisao u programskom jeziku Java, te sam obavio testiranja ispravnosti programa, mjereći potrebno vrijeme i potrošnju radne memorije za izvođenje Viterbijevog algoritma. Dobiveni rezultati su u okvirima odstupanja od 10% u odnosu na promatrane programe CpG Islands (in VB6) i Sequence Manipulation Suite:CpG Islands.
Sažetak (engleski)
In this thesis, I addressed the application of Markov’s Models in bioinformatics. I presented the problem of finding CpG Island using hidden Markov model (HMM). I applied the Viterbi’s algorithm for searching CpG Island in the following sequence. The program was implemented in the Java programming language. The program’s accuracy, speed and consumption of memory were tested. The results are within 10% deviation compared to the observed programs CpG Islands (in VB6) and Sequence Manipulation Suite: CpG Islands.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:518474
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: preddiplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (univ.bacc.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2019-03-13 22:56:30