prikaz prve stranice dokumenta Detekcija varijacija u jednom nukleotidu uporabom metoda dubokog učenja
Rad nije dostupan
diplomski rad
Detekcija varijacija u jednom nukleotidu uporabom metoda dubokog učenja
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2019. urn:nbn:hr:168:790213
Stanojević, Dominik
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Stanojević, D. (2019). Detekcija varijacija u jednom nukleotidu uporabom metoda dubokog učenja (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:790213

Stanojević, Dominik. "Detekcija varijacija u jednom nukleotidu uporabom metoda dubokog učenja." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:790213

Stanojević, Dominik. "Detekcija varijacija u jednom nukleotidu uporabom metoda dubokog učenja." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:790213

Stanojević, D. (2019). 'Detekcija varijacija u jednom nukleotidu uporabom metoda dubokog učenja', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 23.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:790213

Stanojević D. Detekcija varijacija u jednom nukleotidu uporabom metoda dubokog učenja [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2019 [pristupljeno 23.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:790213

D. Stanojević, "Detekcija varijacija u jednom nukleotidu uporabom metoda dubokog učenja", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2019. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:790213

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:790213
Podaci o radu
NaslovDetekcija varijacija u jednom nukleotidu uporabom metoda dubokog učenja
Naslov (engleski)Detection of Single Nucleotide Variations Using Deep Learning
AutorDominik Stanojević
MentorBojana Dalbelo-Bašić (mentor)
Član povjerenstvaBojana Dalbelo-Bašić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaKrešimir Križanović (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMarko Čupić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2019-07-10, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
Detekcija varijacija je veoma važan problem u bioinformatics zbog mnogo razloga. Osim njegove važnosti, problem detekcije varijacija je zanimljiv zbog teške izgradnje efikasnog i preciznog modela. U ovom radu dan je teoretski uvod u problem detekcije varijacija, s posebnim naglaskom na jednonukleotidne varijacije u diploidnim organizmima. U radu su opisani korišteni podaci kao i postupak izgradnje skupa za učenje i testiranje. Također, u radu je opisan prilagođen model ResNet specifično izgrađen za postupak detekcije varijacija. Dani model ostvaruje rezultate usporedive s drugim modelima koristeći manji skup podataka od drugih modela, primjerice modela Clairvoyante.
Sažetak (engleski)
Variant calling, the task of finding variants is extremely important in bioinformatics for various reasons. Expect being important, it is difficult to build efficient and accurate variant caller. This thesis gives theoretical introduction to the variant calling problem, focusing on single nucleotide variants in diploid organisms. The data and dataset generation are described and its application to the custom ResNet model built for variant calling. The model achieves comparable results using only a fraction of data compared to Clairvoyante for predicting single nucleotide variants.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:790213
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2020-01-07 22:07:04