prikaz prve stranice dokumenta Detekcija grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora
Rad nije dostupan
diplomski rad
Detekcija grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2021. urn:nbn:hr:168:247595
Lipovac, Josipa
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Lipovac, J. (2021). Detekcija grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:247595

Lipovac, Josipa. "Detekcija grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:247595

Lipovac, Josipa. "Detekcija grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:247595

Lipovac, J. (2021). 'Detekcija grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 09.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:247595

Lipovac J. Detekcija grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2021 [pristupljeno 09.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:247595

J. Lipovac, "Detekcija grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2021. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:247595

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:247595
Podaci o radu
NaslovDetekcija grupa modificiranih nukleotida u očitanjima RNA dobivenih metodom nanopora
Naslov (engleski)Detection of Modified Nucleotide Clusters in Nanopore Sequenced RNA Reads
AutorJosipa Lipovac
MentorMile Šikić (mentor)
Član povjerenstvaMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDamir Seršić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaKrešimir Križanović (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2021-07-09, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
Glavni cilj ovog diplomskog rada bio je detektiranje grupa modificiranih nukleotida u RNA očitanjima dobivenim sekvencerima treće generacije. Očitanja dobivena sekvencerima treće generacije često sadržavaju veliku količinu šuma. U ovom radu provedene su detaljne analize podataka kako bi se šum pokušao ukloniti te kako bi se podatci mogli bolje razumjeti. Prikazan je trenutni postignuti rad u području ovog problema. Provedeno je grupiranje raznim metodama kao što su K-means, Graph Spectral Clustering te Non-negative matrix factorization. Metode grupiranja testirane su na simuliranim skupovima podataka kao i na stvarnim skupovima podataka. Rezultati su prikazani tablično i grafički.
Sažetak (engleski)
The main goal of this thesis was to detect groups of modified nucleotides in RNA reads obtained by third generation sequencers. Reads obtained by third-generation sequencers often contain a large amount of noise. In this work, detailed analyzes of the data were performed in order to try to remove the noise and so that the data could be better understood. The related work achieved in the area of this problem is shown. Clustering was performed by various methods such as K-means, Graph Spectral Clustering and Non-negative matrix factorization. Clustering methods were tested on simulated datasets as well as on real datasets. The results are presented in tables and graphs.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:247595
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2023-01-13 12:54:11