prikaz prve stranice dokumenta Brzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja
Rad nije dostupan
diplomski rad
Brzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2021. urn:nbn:hr:168:100082
Pratljačić, Suzana
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Pratljačić, S. (2021). Brzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:100082

Pratljačić, Suzana. "Brzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:100082

Pratljačić, Suzana. "Brzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:100082

Pratljačić, S. (2021). 'Brzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 09.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:100082

Pratljačić S. Brzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2021 [pristupljeno 09.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:100082

S. Pratljačić, "Brzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2021. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:100082

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:100082
Podaci o radu
NaslovBrzo preklapanje visoko pouzdanih jednomolekularnih očitanja
Naslov (engleski)Rapid overlapping of Single Molecule High-Fidelity Sequencing Data
AutorSuzana Pratljačić
MentorMile Šikić (mentor)
Član povjerenstvaMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaAna Sović Kržić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaKrešimir Križanović (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2021-07-09, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
Tvrtka Pacific Bioscience 2019. godine predstavila je novu tehnologiju sekvenciranja visoko pouzdanih fragmenata koja kombinira koncepte korištene za sekvenciranje tradicionalnih kratkih i dugačkih očitanja s greškama. Visoko pouzdani fragmenti karakterizirani su velikom duljinom i visokom točnosnu. Činjenica da podatci imaju jako mali broj grešaka može se koristiti za osmišljavanje algoritama koji su manje osjetljivi na pogreške. U ovom radu predstavit ćemo algoritam za mapiranje visoko pouzdanih fragmenata. Algoritam koristi sufiksno polje i seed-chain-align proceduru. Analizirat ćemo performanse i točnost razvijenog alata i usporediti ga sa suvremenim algoritmima za mapiranje.
Sažetak (engleski)
In 2019, Pacific Bioscience introduced highly accurate long-read sequencing (HiFi sequencing), a paradigm that combines concepts from traditional short and long error-prone reads technologies. Long lengths and high base-level resolution characterize the HiFi fragments. These characteristics can be utilized to design algorithms that are less sensitive to errors. In this article, we present the novel algorithm for HiFi reads mapping. The algorithm is based on suffix arrays and a standard seed-chain-align procedure. We will analyze the performance and accuracy of the developed tool and compare it to state-of-the-art algorithms.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:100082
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2023-01-13 13:33:15