U ovom radu opisana je teorijska osnova važnosti upravljanja kakvoćom površinskih voda te su analizirani mikrobiološki pokazatelji kakvoće vode za kupanje. Ispitivanje kakvoće voda za kupanje obuhvaća ispitivanje fizikalno-kemijskih i mikrobioloških osobina površinskih voda koje upućuju na potencijalni rizik od zaraznih bolesti prilikom korištenja površinskih voda za rekreaciju. Mikrobiološki pokazatelji smatraju se najznačajnijim indikatorima onečišćenja površinskih voda sanitarno-fekalnim otpadnim vodama. Jezera Jarun i Bundek najpoznatija su kupališta na području Zagreba i okolice. Koriste se za kupanje, rekreaciju, ribolov i odmor. Obale jezera proglašena su plažom te se kakvoća vode sustavno motri. U radu je analizirana kakvoća vode za kupanje koja se odredila uzorkovanjem vode tijekom 2014., 2015. i 2016. g. u sezoni kupanja na tri lokacije na području jezera Bundeka i šesnaest lokacija na području jezera Jarun. Provedena su ispitivanja kojima su određene vrijednosti mikrobioloških pokazatelja kakvoće vode: Escherichie coli i crijevnih enterokoka. Navedene bakterije obitavaju u ljudskom probavnom traktu međutim ukoliko se nađu izvan probavnog sustava djeluju patogeno odnosno izazivaju brojne bolesti. Mikrobiološki pokazatelji određeni su metodom membranske filtracije koja je najpogodnija za vode sa nižim brojem bakterijskih kolonija odnosno za površinske vode. Rezultati su prikazani kao broj izraslih kolonija u 100 mL uzorka (bik/100 mL). Broj i vrsta indikatorskih bakterija variraju ovisno o vremenskim uvjetima, opterećenju vode za kupanje otpadnim vodama te kontaminaciji okolnog tla.