prikaz prve stranice dokumenta In silico probir derivata kumarina i L-askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 - pametni dizajn novih kemoterapeutika
  Preuzmi
PDF 3.07 MB
diplomski rad
In silico probir derivata kumarina i L-askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 - pametni dizajn novih kemoterapeutika
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Medicinski fakultet, 2018. urn:nbn:hr:105:700716
Ister, Rok
Sveučilište u Zagrebu
Medicinski fakultet
KATEDRA ZA MEDICINSKU KEMIJU, BIOKEMIJU I KLINIČKU KEMIJU

Institucijski repozitorij: Dr Med - digitalni repozitorij Medicinskog fakulteta Sveučilišta u Zagrebu

Citirajte ovaj rad

Ister, R. (2018). In silico probir derivata kumarina i L-askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 - pametni dizajn novih kemoterapeutika (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Medicinski fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:700716

Ister, Rok. "In silico probir derivata kumarina i L-askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 - pametni dizajn novih kemoterapeutika." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Medicinski fakultet, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:700716

Ister, Rok. "In silico probir derivata kumarina i L-askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 - pametni dizajn novih kemoterapeutika." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Medicinski fakultet, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:700716

Ister, R. (2018). 'In silico probir derivata kumarina i L-askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 - pametni dizajn novih kemoterapeutika', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Medicinski fakultet, citirano: 25.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:700716

Ister R. In silico probir derivata kumarina i L-askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 - pametni dizajn novih kemoterapeutika [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Medicinski fakultet; 2018 [pristupljeno 25.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:700716

R. Ister, "In silico probir derivata kumarina i L-askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 - pametni dizajn novih kemoterapeutika", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Medicinski fakultet, Zagreb, 2018. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:700716

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:105:700716
Podaci o radu
NaslovIn silico probir derivata kumarina i L-askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 - pametni dizajn novih kemoterapeutika
Naslov (engleski)In silico screening of coumarin and L-ascorbic acid derivatives on histone demethylaze LSD1 - rational design of new chemotherapeutics
AutorRok Ister
MentorDonatella Verbanac (mentor)
Član povjerenstvaVLADIMIR TRKULJA (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaSanja Dolanski-Babić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaDonatella Verbanac (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Medicinski fakultet
(KATEDRA ZA MEDICINSKU KEMIJU, BIOKEMIJU I KLINIČKU KEMIJU)
Zagreb
Datum i država obrane2018-07-13, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO
Temeljne medicinske znanosti
Medicinska biokemija
Sažetak
Razvoj novih lijekova podrazumijeva dugotrajan i skup proces. Uključivanje stručnjaka iz svih područja omogućuje smanjivanje rizika od gubitka potencijalno kvalitetnih molekula tijekom tog procesa te su danas interdisciplinarni timovi imperativ za osiguravanje uspješnosti i brzine odvijanja samog tijeka istraživanja i razvoja novih terapijskih opcija. Budući da je razvoj novih tehnologija i kompjuterskih/računskih programa omogućio relativno uspješno predviđanje ponašanja molekula u biološkim sustavima te je doprinio i ukupnom smanjenju troškova razvoja, upotreba računalne kemije danas je od velikog značaja i uvelike se koristi u farmaceutskoj industriji i u ostalim sustavima koji se bave problematikom iznalaženja novih obećavajućih molekula. U ovom radu je sa skupom novosintetiziranih hibridnih spojeva (33 kumarinsko-1,2,3-triazolna i 61 askorbinsko-1,2,3-triazolna derivata) provedeno molekularno uklapanje na poznatoj ciljnoj molekuli enzimu, LSD1 (lizin-specifičnoj demetilazi 1) kako bi se između navedenog skupa spojeva probrale aktivne molekule i pokušao pretpostaviti mehanizam njihove inhibicije ciljanog enzima koji sudjeluje u epigenetskoj regulaciji stanice. LSD1 igra vrlo važnu ulogu u modifikaciji epigenetskog izražaja stanice uklanjajući metilne skupine s lizina na histonskim podjedinicama i pojačano je izražen u neoplastičnim stanicama određenih vrsta tumora. Model je postavljen koristeći poznate reverzibilne inhibitore LSD1 i pomoću određenih graničnih vrijednosti između aktivnih i neaktivnih spojeva probran je podskup spojeva za daljnja in vitro testiranja. Također, metodom definicije dva vezna mjesta predloženi su strukturni mehanizmi inhibicije otvarajući time mogućnost pametnog dizajniranja novih lijekova u bliskoj budućnosti koji ciljaju na enzim LSD1 kao mjesto djelovanja.
Sažetak (engleski)
Development of a new drug has become an expensive and long endeavor. Of the ultimate importance is acting through the multi- and inter-disciplinary teams, minimizing in this way most of the risks while selecting the most promising molecules for the further development. Computational chemistry and new technologies have enabled significant reduction of the risk of attrition during preclinical drug development. In this work the results obtained on the set of newly synthetized hybrid compounds (33 coumarin-1,2,3-triazole and 61 L-ascorbic acid-1,2,3-triazole derivatives) on which molecular docking on the target protein has been performed, are reported. The target protein lysine-specific histone demethylase 1 (LSD1) is responsible for the epigenetic regulation within the cells. Epigenetics has been widely used in the last decade aiming also towards control of the proliferation and development of neoplastic growth. LSD1 plays an important role in modification of epigenetic behavior of the cell and as enzyme it is overexpressed in many types of malignancies. Our model was set-up utilizing known reversible inhibitors of LSD1 as comparable standards and utilizing results from the docking studies with the set of newly synthesized molecules. The results obtained are highly useful and will serve in rational drug development of further derivatives aimed to inhibit devastation activity of LSD1 as a target protein/enzyme.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:105:700716
Studijski programNaziv: Medicina
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: integrirani preddiplomski i diplomski
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica medicine (dr. med.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2019-03-20 11:29:17