Kolonoskopija služi kao zlatni standard za probir, dijagnostiku i kontroliranje bolesti debelog crijeva, npr. za karcinom debelog crijeva. Kolonoskopija, kao i svaki drugi pregled ili liječnička intervencija, ima svoje komplikacije, od kojih je najozbiljnija i najopasnija perforacija debelog crijeva koja može rezultirati značajnim morbiditetom i mortalitetom. Perforaciju debelog crijeva kolonoskopom treba što ranije otkriti i odmah početi liječiti. Postoje tri načina liječenja perforacije – endoskopsko, konzervativno i kirurško liječenje. Ako je perforacija kolona dijagnosticirana za vrijeme kolonoskopije može se liječiti endoskopski. U slučaju da je perforacija dijagnosticirana nakon kolonoskopije može se liječiti konzervativno ili kirurški. Kirurško liječenje podrazumijeva laparotomiju i laparoskopiju, koje mogu biti eksplorativne i terapijske. Neki smatraju da je eksplorativno kirurško liječenje bolje od konzervativnog jer odgađanje reparacije perforacije dovodi do većeg rizika za nastanak komplikacija perforacije. Postoje mnoge rasprave o tome koji način liječenja je najbolji jer je perforacija kolona kolonoskopom rijetka komplikacija (<1%), te zasebne institucije/bolnice nisu mogle prikupiti dovoljno podataka o liječenju perforacije debelog crijeva kolonoskopom da bi mogli donijeti strateški terapijski plan. World Society of Emergancy Surgery (WSES) je 2017. godine objavila rad u kojem su prikupljeni i obrađeni svi podaci iz radova koji su obrađivali perforacije debelog crijeva i njihovo liječenje, te su objavili smjernice o tome kako pristupiti pacijentima s perforacijom kolona uzrokovanom kolonoskopom.