Naslov MALDI-TOF analiza peptidoma stolice Naslov (engleski) MALDI-TOF analysis of stool peptidome Autor Martina Firić Mentor Dario Mandić (mentor)Član povjerenstva Sanja Mandić (predsjednik povjerenstva)Član povjerenstva Vatroslav Šerić (član povjerenstva)Član povjerenstva Dario Mandić (član povjerenstva)Ustanova koja je dodijelila Sveučilište Josipa Jurja Strossmayera u Osijeku Datum i država obrane 2022-09-23, Hrvatska Znanstveno / umjetničko BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO Sažetak CILJEVI ISTRAŽIVANJA. Usporediti prisutnost karakterističnih peptida u stolici bolesnika
oboljelih od ulceroznog kolitisa (UC) i Chronove bolesti (CD) sa stolicom zdrave osobe te
ispitati postoji li statistički značajna razlika u prisutnosti pojedinih peptida u stolici bolesnika
koji bi omogućili diferencijaciju bolesnika s UC-om i CD-om.
USTROJ STUDIJE. Istraživanje je provedeno kao presječna studija.
ISPITANICI I METODE. Analizirano je 10 uzoraka stolice oboljelih od CD, 10 uzoraka
stolice oboljelih od UC-a te 10 uzoraka stolice prikupljenih od zdravih kontrola bez upalnih
bolesti crijeva. Uzorci su pripremljeni ekstrakcijom u vodi, ponovnom ekstrakcijom u
organskom otapalu, uparavanjem i uklanjanjem soli ZipTip metodom prema uputama
proizvođača. Pripremljeni uzorci analizirani su na MALDI-TOF uređaju Bruker UltrafleXtreme
(Bruker Daltonics, Bremen, Germany) u rasponu od 1000-4000 m/z u pozitivnom reflektron
modu s HCCA kao matriksom.
REZULTATI. U ispitivanim uzorcima traženi su peptidi karakteristični za kontrole, za
zajedničke uzorke kontrole i oboljelih, najznačajniji dijagnostički peptidi, peptidi
karakteristični za UC, peptidi karakteristični za CD te ukupni peptidi karakterističnih za IBD.
Statistički značajne razlike uočene su u svim skupinama karakterističnih peptida ukoliko se
promatraju testirane skupine kontrola u odnosu na ukupno oboljele od upalnih bolesti crijeva
(CD + UC). Statistički značajne razlike u pojavnosti karakterističnih peptida za razlikovanje
UC-a i CD-a pronađene su za peptide karakteristične za CD.
ZAKLJUČAK. Postoji statistički značajna razlika u pojavnosti svih ispitivanih
karakterističnih peptida u uzorcima bolesnika s upalnim bolestima crijeva (UC i CD) sa
uzorcima zdravih kontrolnih uzoraka. Nisu pronađene dovoljne razine razlike u pojavnosti
karakterističnih peptida koje bi omogućile praktično razlikovanje uzoraka oboljelih od UC i CD
budući da su se u našem istraživanju karakteristični CD peptidi našli i kod manjeg broja
kontrolnih uzoraka.
KLJUČNE RIJEČI. Chronova bolest; MALDI-TOF; ulcerozni kolitis; upalne bolesti crijeva
Sažetak (engleski) OBJECTIVES: The first objective of this study was to compare the presence of specific
peptides that can be found in the stool of patients diagnosed with inflammatory bowel disease
(IBD) (ulcerative colitis, UC and Crohn's disease, CD) with the stool of a healthy person. The
second objective was to examine whether there are differences in the presence of certain
peptides in the stool sample of a UC patient compared to the stool sample of a CD patient and
whether that would help in differentiation UC from CD.
STUDY DESIGN: The study was done as a cross-sectional study.
PARTICIPANTS AND METHODS: Ten stool samples from patients diagnosed with CD,
ten stool samples from patients diagnosed with UC and ten stool samples from healthy controls
(K) were analyzed. Samples were prepared by extraction in water, re-extraction in an organic
solvent, evaporation and desalting using the ZipTip method according to the manufacturer's
instructions. The prepared samples were analyzed on a MALDI-TOF mass spectrometer Bruker
UltrafleXtreme (Bruker Daltonics, Bremen, Germany) in the range of 1000-4000 m/z in
positive reflectron mode with HCCA as matrix.
RESULTS: In tested samples we have searched for specific peptides: peptides specific for
control samples, peptides specific for control samples and samples of IBD patients, the most
significant diagnostic peptides for IBD, peptides specific for UC, peptides specific for CD and
the total peptides that can be found in IBD patients. Statistically significant differences were
found for all groups of characteristic peptides when samples from control group and samples
from IBD patients (UC and CD) were compared. Statistically significant differences between
UC and CD samples were found for peptides specific for CD.
CONCLUSION: There is a significant difference in the presence of specific peptides in the
stool of patients diagnosed with IBD in regard to the stool of a healthy person. Sufficient levels
of difference in specific peptide frequency which would allow practical differentiation of UC
and CD samples have not been found because in our research small number of specific CD
peptides were found in control samples too.
Ključne riječi
Chronova bolest
MALDI-TOF
ulcerozni kolitis
upalne bolesti crijeva
Ključne riječi (engleski)
Chron's disease
inflammatory bowel diseases
MALDI-TOF
ulcerative colitis
Jezik hrvatski URN:NBN urn:nbn:hr:152:302826 Studijski program Naziv: Medicinsko laboratorijska dijagnostika Vrsta resursa Tekst Način izrade datoteke Izvorno digitalna Prava pristupa Otvoreni pristup Uvjeti korištenja Datum i vrijeme pohrane 2024-03-21 07:11:12
