prikaz prve stranice dokumenta Izrada SQL upita za analizu bioloških podataka
  Preuzmi
PDF 1.71 MB
diplomski rad
Izrada SQL upita za analizu bioloških podataka
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2019. urn:nbn:hr:159:087957
Plec, Andrea
Sveučilište u Zagrebu
Prehrambeno-biotehnološki fakultet
Zavod za biokemijsko inženjerstvo
Kabinet za bioinformatiku

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prehrambeno-biotehnološkog fakulteta u Zagrebu

Citirajte ovaj rad

Plec, A. (2019). Izrada SQL upita za analizu bioloških podataka (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:087957

Plec, Andrea. "Izrada SQL upita za analizu bioloških podataka." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:087957

Plec, Andrea. "Izrada SQL upita za analizu bioloških podataka." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:087957

Plec, A. (2019). 'Izrada SQL upita za analizu bioloških podataka', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, citirano: 25.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:087957

Plec A. Izrada SQL upita za analizu bioloških podataka [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet; 2019 [pristupljeno 25.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:087957

A. Plec, "Izrada SQL upita za analizu bioloških podataka", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, Zagreb, 2019. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:087957

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:087957
Podaci o radu
NaslovIzrada SQL upita za analizu bioloških podataka
Naslov (engleski)Building SQL queries for biological data analysis
AutorAndrea Plec
MentorJanko Diminić (mentor)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prehrambeno-biotehnološki fakultet
(Zavod za biokemijsko inženjerstvo)
(Kabinet za bioinformatiku)
Zagreb
Datum i država obrane2019-12-12, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOTEHNIČKE ZNANOSTI
Biotehnologija
Sažetak
Zahvaljujući mnogim istraživanjima, crijevna mikrobiota se pokazala kao važna komponenta fiziologije čovjeka s kojim živi u mutualističkom odnosu. S obzirom da je riječ o kompleksnoj zajednici mikroorganizama na čiji sastav utječu mnogobrojni unutarnji i vanjski čimbenici, svaki pojedinac posjeduje jedinstveni sastav crijevne mikrobiote. Disbioza crijevne mikrobiote može dovesti do raznih upalnih i metaboličkih poremećaja, što može rezultirati bolestima. Utvrđivanje sličnosti i razlika među zdravim i bolesnim skupinama pojedinaca pruža mogućnost određivanja povezanosti sastava crijevne mikrobiote s tim poremećajima i bolestima. U tu svrhu se provodi sekvenciranje mnogobrojnih uzoraka crijevne mikrobiote, a dobivena očitanja se zatim bioinformatički obrađuju te se rezultati pohranjuju u baze podataka. U ovom radu je u sklopu računalnog paketa MySQL korištena baza podataka koja sadrži brojnosti pojedinih taksona za 1639 uzoraka crijevne mikrobiote. Korištenjem računalnog jezika SQL izrađeni su pohranjeni postupci za analizu raznolikosti sastava pojedinih uzoraka i procjenu prosječnog sastava za sve uzorke.
Sažetak (engleski)
According to numerous studies, gut microbiota lives in a mutualistically beneficial relationship with humans and has proven to be an important component of their physiology. Each individual has a unique gut microbiota composition, given that it’s a complex community of microorganisms whose composition is affected by many internal and external factors. Dysbiosis of the gut microbiota can lead to various inflammatory and metabolic disorders, which can result in illness. Determining similarities and differences among healthy and affected cohorts provides an opportunity to establish correlations between gut microbiota composition and various afflictions. Such research requires sequencing of numerous intestinal microbiota samples. The acquired sequence reads are then bioinformatically processed and the results are stored in databases. In order to build several stored procedures using SQL, a database containing taxa abundance of 1639 gut microbiota samples was used. The stored procedures were built within MySQL database management system, and used to analyze the composition diversity of individual samples and to estimate the average composition for all samples.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:159:087957
Studijski programNaziv: Molekularna biotehnologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka molekularne biotehnologije (mag. ing. biotechn.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Imenovanje-Bez prerada 4.0 međunarodna (CC BY-ND 4.0)
Datum i vrijeme pohrane2020-01-28 12:06:09