prikaz prve stranice dokumenta Karakterizacija interakcije humanih proteina SPRTN I p97 metodom supročišćavanja afinitetnom kromatografijom
Pristup korisnicima matične ustanove
diplomski rad
Karakterizacija interakcije humanih proteina SPRTN I p97 metodom supročišćavanja afinitetnom kromatografijom
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2022. urn:nbn:hr:159:046928
Vukasović-Lončar, Vedrana
Sveučilište u Zagrebu
Prehrambeno-biotehnološki fakultet
Zavod za kemiju i biokemiju
Laboratorij za biokemiju

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prehrambeno-biotehnološkog fakulteta u Zagrebu

Citirajte ovaj rad

Vukasović Lončar, V. (2022). Karakterizacija interakcije humanih proteina SPRTN I p97 metodom supročišćavanja afinitetnom kromatografijom (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:046928

Vukasović Lončar, Vedrana. "Karakterizacija interakcije humanih proteina SPRTN I p97 metodom supročišćavanja afinitetnom kromatografijom." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:046928

Vukasović Lončar, Vedrana. "Karakterizacija interakcije humanih proteina SPRTN I p97 metodom supročišćavanja afinitetnom kromatografijom." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:046928

Vukasović Lončar, V. (2022). 'Karakterizacija interakcije humanih proteina SPRTN I p97 metodom supročišćavanja afinitetnom kromatografijom', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, citirano: 06.05.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:046928

Vukasović Lončar V. Karakterizacija interakcije humanih proteina SPRTN I p97 metodom supročišćavanja afinitetnom kromatografijom [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet; 2022 [pristupljeno 06.05.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:046928

V. Vukasović Lončar, "Karakterizacija interakcije humanih proteina SPRTN I p97 metodom supročišćavanja afinitetnom kromatografijom", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, Zagreb, 2022. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:046928

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:046928
Podaci o radu
NaslovKarakterizacija interakcije humanih proteina SPRTN I p97 metodom supročišćavanja afinitetnom kromatografijom
Naslov (engleski)Characterization of SPRTN protein interaction with p97 using pull-down assay
AutorVedrana Vukasović-Lončar
MentorIgor Stuparević (mentor)
Član povjerenstvaVišnja Gaurina-Srček (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMarta Popović (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIgor Slivac (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prehrambeno-biotehnološki fakultet
(Zavod za kemiju i biokemiju)
(Laboratorij za biokemiju)
Zagreb
Datum i država obrane2022-09-22, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOTEHNIČKE ZNANOSTI
Biotehnologija
Sažetak
Križne veze DNA i proteina (engl. DNA-protein crosslinks, DPCs) česta su vrsta oštećenja DNA koja nastaju kovalentnim i ireverzibilnim vezanjem proteina na DNA. Riječ je o velikim lezijama koje sterički ometaju procese koji se odvijaju na DNA poput replikacije, transkripcije, rekombinacije i popravka. Nepopravljeni DPC-ovi narušavaju stabilnost genetičkog materijala i funkciju stanica. U nedavno otkrivenom proteolitičkom putu popravka križnih veza DNA i proteina sudjeluju proteaza Wss1 u kvascu i SPRTN u metazoama. Gen koji kodira za SPRTN esencijalan je u sisavaca te mutacijama uzrokuje SPARTAN ili Ruijs-Aalfs sindrom karakterizaran preuranjenim starenjem, kromosomskom nestabilnošću i karcinomom jetre u mladoj dobi. SPRTN stupa u interakciju s p97/VCP AAA ATPazom koja potencijalno sudjeluje u proteolitičkom putu popravka. U ovom radu pripravljeni su konstrukti različitih duljina humanih proteina SPRTN i p97 koji su prekomjerno eksprimirani u bakteriji Escherichia coli, pročišćeni afinitetnom kromatografijom i prema potrebi gel-filtracijom. Potom je određeno njihovo mjesto interakcije metodom supročišćavanja afinitetnom kromatografijom. Rezultati ukazuju na to da su SHP motiv SPRTN-a i N-D1 domene p97 ključne za interakciju između SPRTN i p97 proteina. Dobiveni rezultati biti će iskorišteni za daljnju strukturnu analizu SPRTN:p97 kompleksa metodom rendgenske kristalografije i krio-elektronske mikroskopije.
Sažetak (engleski)
DNA-protein crosslinks (DPCs) are a frequent type of DNA lesion caused by covalent and irreversible binding of proteins to DNA. These are large lesions that sterically interfere with processes that occur on DNA such as replication, transcription, recombination and repair. Unrepaired DPCs affect the stability of genetic material and cell function. The proteases Wss1 in yeast and SPRTN in metazoans are involved in the recently discovered repair of DNA-protein crosslinks by proteolysis. The gene encoding SPRTN is essential in mammals and its mutations cause SPARTAN or Ruijs-Aalfs syndrome, which is characterized by premature ageing, chromosomal instability and early liver cancer. SPRTN interacts with p97/VCP AAA ATPase which may be involved in the proteolytic repair pathway. In this work, constructs of different lengths of the human SPRTN and p97 proteins were overexpressed in Escherichia coli, purified by affinity chromatography and, if necessary, by gel-filtration. Pull-down assays were performed to identify their interaction sites, indicating that the SPRTN SHP motif and the p97 N-D1 domains are crucial for this interaction. These results thus provide valuable information for further structural analyses of the SPRTN:p97 complex by X-ray crystallography and cryo-electron microscopy.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:159:046928
Studijski programNaziv: Molekularna biotehnologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka molekularne biotehnologije (mag. ing. biotechn.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaPristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2023-02-13 13:29:17