prikaz prve stranice dokumenta Ekspresija domene SprT proteina ACRC i analiza vezanja ACRC i DNA in vitro
  Preuzmi
PDF 2.27 MB
diplomski rad
Ekspresija domene SprT proteina ACRC i analiza vezanja ACRC i DNA in vitro
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. urn:nbn:hr:217:485031
Valičević, Josipa
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Kemijski odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Valičević, J. (2021). Ekspresija domene SprT proteina ACRC i analiza vezanja ACRC i DNA in vitro (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:485031

Valičević, Josipa. "Ekspresija domene SprT proteina ACRC i analiza vezanja ACRC i DNA in vitro." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:485031

Valičević, Josipa. "Ekspresija domene SprT proteina ACRC i analiza vezanja ACRC i DNA in vitro." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:485031

Valičević, J. (2021). 'Ekspresija domene SprT proteina ACRC i analiza vezanja ACRC i DNA in vitro', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 31.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:485031

Valičević J. Ekspresija domene SprT proteina ACRC i analiza vezanja ACRC i DNA in vitro [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2021 [pristupljeno 31.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:485031

J. Valičević, "Ekspresija domene SprT proteina ACRC i analiza vezanja ACRC i DNA in vitro", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2021. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:485031

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:485031
Podaci o radu
NaslovEkspresija domene SprT proteina ACRC i analiza vezanja ACRC i DNA in vitro
Naslov (engleski)Expression of ACRC SprT domain and ACRC:DNA binding analysis in vitro
AutorJosipa Valičević
MentorNives Ivić (mentor)
Član povjerenstvaDubravka Matković-Čalogović (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaJasmina Rokov Plavec (član povjerenstva)
Član povjerenstvaĐani Škalamera (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMarko Močibob (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Kemijski odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2021-09-29, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Kemija
Sažetak
Unakrsna veza DNA-protein (engl. DNA-protein crosslink, DPC) specifičan je tip oštećenja molekule DNA koji nastaje kao posljedica ireverzibilne kovalentne veze proteina i DNA. S obzirom na važnost genetičke informacije pohranjene u DNA, oštećenja kao što su DPC rezultirala bi gubitkom integriteta molekule DNA. Proučavanjem metaloproteaza, Wss1 i SPRTN, otkriveno je da sadrže domenu SprT koja sudjeluje u popravku DPC-a. Nedavno je otkriveno da protein ACRC (engl. Acidic containing-repeat protein, ACRC) također ima očuvanu domenu SprT, što daje zaključiti da je uključen u popravak spomenutog oštećenja. Kako bi se strukturno i biokemijski okarakterizirala domena SprT proteina ACRC dizajnizani su konstrukti domene različitih duljina. Konstrukti su klonirani, testirana je njihova nadekspresija u bakteriji Escherichia coli i njihova topljivost. U želji za razumijevanjem uloge ACRC-a u popravku DPC-a pročišćeni su humani proteini ACRC i njegov katalitički mutant E593A, te je ispitano njihovo vezanje na različite molekule DNA (dvolančanu, jednolančanu i u obliku rašlji), a od sva tri tipa najbolje je vezanje na DNA u obliku rašlji.
Sažetak (engleski)
DNA-protein crosslink (DPC) is a specific type of DNA damage that occurs as a result of the formation of an irreversible covalent bond between DNA and protein. Given the importance of genetic information stored in DNA, damage such as DPC would result in losing DNA integrity. Previously, metalloproteases Wss1 and SPRTN were found to contain the SprT domain involved in DPC repair. Recently, it has been discovered that ACRC (Acidic containing-repeat protein) protein also has the preserved SprT domain, which suggests its involvement in DPC repair. In order to structurally and biochemically characterize the SprT domain of the ACRC protein, domain constructs of different lengths were designed. The constructs were cloned, their overexpression in Escherichia coli and their solubility were tested. In order to understand the role of ACRC in DPC repair, human ACRC protein and its catalytic mutant E593A were purified and their binding to different DNA molecules (doublestranded, forked and single-stranded) were examined. Of all three types, binding to the fork type of DNA molecule was the best.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:485031
ProjektŠifra: IPS-2020-01-4225
Naziv: Strukturna karakterizacija faktora uključenih u popravak unakrsnog vezanja DNA-protein
Voditelj: Marta Popović
Pravna nadležnost: Hrvatska
Financijer: HRZZ
Linija financiranja: IPS
Studijski programNaziv: Kemija; smjerovi: istraživački
Smjer: istraživački
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra kemije (mag. chem.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2023-09-29
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2021-10-26 13:37:12