prikaz prve stranice dokumenta Komparativna analiza fosfoproteoma sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode oksitetraciklin
  Preuzmi
PDF 6.62 MB
disertacija
Komparativna analiza fosfoproteoma sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode oksitetraciklin
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. urn:nbn:hr:217:263138
Šarić, Ela
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Šarić, E. (2022). Komparativna analiza fosfoproteoma sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode oksitetraciklin (Disertacija). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:263138

Šarić, Ela. "Komparativna analiza fosfoproteoma sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode oksitetraciklin." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:263138

Šarić, Ela. "Komparativna analiza fosfoproteoma sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode oksitetraciklin." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:263138

Šarić, E. (2022). 'Komparativna analiza fosfoproteoma sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode oksitetraciklin', Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 26.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:263138

Šarić E. Komparativna analiza fosfoproteoma sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode oksitetraciklin [Disertacija]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2022 [pristupljeno 26.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:263138

E. Šarić, "Komparativna analiza fosfoproteoma sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode oksitetraciklin", Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2022. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:263138

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:263138
Podaci o radu
NaslovKomparativna analiza fosfoproteoma sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode oksitetraciklin
Naslov (engleski)Comparative phosphoproteome analysis of Streptomyces rimosus oxytetracycline producers strains
AutorEla Šarić
MentorDušica Vujaklija (mentor)
Član povjerenstvaKsenija Zahradka (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaIvana Ivančić Baće (član povjerenstva)
Član povjerenstvaSaša Kazazić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2022-10-07, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		578/579 - Virologija. Mikrobiologija
Sažetak
Streptomiceti su višestanične bakterije složenog životnog ciklusa. Najpoznatije su po genetičkom potencijalu za sintezu antibiotika širokog spektra u koje spadaju i tetraciklini od izuzetnog komercijalnog značaja. Već desetljećima se bakterija Streptomyces rimosus koristi za proizvodnju oksitetraciklina (OTC) čija godišnja potrošnja prelazi 108 kg. Biosinteza antibiotika je kontrolirana kompleksnim signalnim putevima koji uključuju i fosforilacije proteina. Kako bi rasvijetlili regulatorne mehanizme uključene u procese odgovorne za rast i sintezu OTC-a u ovoj doktorskoj radnji je primjenom spektrometrije masa po prvi put istražen (fosfo)proteom bakterije S. rimosus G7 i visokog proizvođača OTC-a (soj 23383). Određena je dinamika sinteze (fosfo)proteina tijekom rasta ovih bakterija, a ostvareni rezultati su korelirani s procesima uključenim u biosintezu antibiotika i staničnu diferencijaciju. Identificirano je 4053 proteina (~50% proteoma) te 433 fosfoproteina od kojih je 203 fosfoproteina pronađeno samo kod soja 23383. Funkcionalna karakterizacija i analiza dinamike fosforilacije ovih proteina dali su posve novi uvid u fosfoproteom streptomiceta općenito. Identificirana je do sada neopisana posttranslacijska modifikacija niza proteina koji su važni za staničnu diobu i metabolizam te sintezu antibiotika i odgovor na stres.
Sažetak (engleski)
Streptomycetes are multicellular bacteria with a complex life cycle. They are best known for their great potential for the synthesis of broad-spectrum antibiotics, which include tetracyclines of significant commercial importance. For decades, Streptomyces rimosus has been used to produce oxytetracycline (OTC) whose annual consumption exceeds 108 kg. Antibiotic biosynthesis is controlled by complex signaling pathways that include protein phosphorylation. In order to elucidate the regulatory mechanisms involved in the processes responsible for bacterial growth and OTC synthesis, the (phospho)proteome of S. rimosus G7 and a high OTC producer (strain 23383) was investigated for the first time using mass spectrometry in this doctoral dissertation. The dynamics of (phospho)proteomes during the growth of these bacteria was determined and results were correlated with the processes involved in antibiotic biosynthesis and cell differentiation. In total, 4053 proteins (~ 50% of proteomes) and 433 phosphoproteins were identified, of which 203 phosphoproteins were found only in strain 23383. Functional characterization and analysis of phosphorylation dynamics of these proteins gave a completely new insight into streptomycete phosphoproteins in general. So far undescribed posttranslational modification of a number of proteins important for cell division and metabolism, as well as antibiotic synthesis and stress response, has been identified.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:263138
Datum promocije2022
Studijski programNaziv: Biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: poslijediplomski doktorski
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2024-10-07
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2022-11-17 11:45:33