prikaz prve stranice dokumenta DIVERSITY OF DIATOM AND BACTERIAL COMMUNITIES ASSOCIATED WITH LOGGERHEAD SEA TURTLES (CARETTA CARETTA)
  Preuzmi
PDF 30 MB
disertacija
DIVERSITY OF DIATOM AND BACTERIAL COMMUNITIES ASSOCIATED WITH LOGGERHEAD SEA TURTLES (CARETTA CARETTA)
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. urn:nbn:hr:217:718540
Filek, Klara
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Filek, K. (2022). DIVERSITY OF DIATOM AND BACTERIAL COMMUNITIES ASSOCIATED WITH LOGGERHEAD SEA TURTLES (CARETTA CARETTA) (Disertacija). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:718540

Filek, Klara. "DIVERSITY OF DIATOM AND BACTERIAL COMMUNITIES ASSOCIATED WITH LOGGERHEAD SEA TURTLES (CARETTA CARETTA)." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:718540

Filek, Klara. "DIVERSITY OF DIATOM AND BACTERIAL COMMUNITIES ASSOCIATED WITH LOGGERHEAD SEA TURTLES (CARETTA CARETTA)." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:718540

Filek, K. (2022). 'DIVERSITY OF DIATOM AND BACTERIAL COMMUNITIES ASSOCIATED WITH LOGGERHEAD SEA TURTLES (CARETTA CARETTA)', Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 24.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:718540

Filek K. DIVERSITY OF DIATOM AND BACTERIAL COMMUNITIES ASSOCIATED WITH LOGGERHEAD SEA TURTLES (CARETTA CARETTA) [Disertacija]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2022 [pristupljeno 24.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:718540

K. Filek, "DIVERSITY OF DIATOM AND BACTERIAL COMMUNITIES ASSOCIATED WITH LOGGERHEAD SEA TURTLES (CARETTA CARETTA)", Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2022. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:718540

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:718540
Podaci o radu
NaslovDIVERSITY OF DIATOM AND BACTERIAL COMMUNITIES ASSOCIATED WITH LOGGERHEAD SEA TURTLES (CARETTA CARETTA)
Naslov (hrvatski)RAZNOLIKOST MIKROBNIH ZAJEDNICA DIJATOMEJA I BAKTERIJA GLAVATIH ŽELVI (CARETTA CARETTA)
AutorKlara Filek
MentorSunčica Bosak (mentor)
Član povjerenstvaTomislav Ivanković (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaZrinka Ljubešić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2022-11-29, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		57 - Biološke znanosti. Fizička antropologija. Bioraznolikost
Sažetak
Loggerhead sea turtles are ancient marine reptiles inhabiting the oceans worldwide. They are colonized by microorganisms both in the gastrointestinal tract and on their carapace and skin. In this thesis that consists of four scientific publications, the loggerhead sea turtle-associated diatom and bacterial communities were investigated by high-throughput sequencing of chloroplast rbcL gene and 16S rRNA gene, and cultivation. The culture-independent approach has shown that loggerheads harbor diverse but stable bacterial communities in their cloaca, and that the oral microbiota reflects the turtle’s environment. The carapace and skin harbor complex microbial communities often rich in as yet unclassified taxa. Diatoms isolated from carapace and skin were cultivated as xenic monocultures and further characterized using morphology and molecular techniques to elucidate their identity and phylogeny. Novel diatom taxa were discovered, often belonging to the genera Craspedostauros, Fallacia, or Amphora genus. Cultivated diatoms also enabled the characterization of the phycosphere and isolation of diatom-associated bacterial strains.
Sažetak (hrvatski)
Glavate želve su drevni morski gmazovi koji nastanjuju svjetska mora i oceane. Njihov probavni sustav te oklop i koža kolonizirani su mikroorganizmima. U ovoj disertaciji čiji su rezultati predstavljeni u sklopu četiri znanstvene publikacije, mikrobne zajednice dijatomeja i bakterija glavatih želvi su analizirane koristeći molekularne metode sekvenciranja visoke protočnosti kloroplastnog rbcL gena i 16S rRNA gena te kultiviranjem. Rezultati metoda neovisnih o kultivaciji su pokazali da su bakterijske zajednice u kloaki glavate želve raznolike ali stabilne te da oralna mikrobiota reflektira okoliš u kojem se kornjača nalazi. Karapaks i koža podloga su složenim mikrobnim zajednicama u kojima su često prisutni još uvijek nepoznati mikroorganizmi. Dijatomeje izolirane s karapaksa i kože kultivirane su kao ksenične monokulture te su korištene morfološke i molekularne metode za njihovu identifikaciju i određivanje filogenije. Otkrivene su nove svojte dijatomeja unutar rodova Craspedostauros, Fallacia i Amphora. Kultivacija dijatomeja također je omogućila analizu fikosfere te izolaciju pripadajućih bakterijskih sojeva.
Ključne riječi
Ključne riječi (hrvatski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:718540
Datum promocije2022
Studijski programNaziv: Biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: poslijediplomski doktorski
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2023-09-29
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2022-12-06 12:11:36