prikaz prve stranice dokumenta CELL LINES WITH INTEGRATED CRISPRa AND CRISPRi SYSTEM AND THEIR APPLICATION IN ANALYSIS OF IMMUNOGLOBULIN G GLYCOSYLATION
  Preuzmi
PDF 14.82 MB
disertacija
CELL LINES WITH INTEGRATED CRISPRa AND CRISPRi SYSTEM AND THEIR APPLICATION IN ANALYSIS OF IMMUNOGLOBULIN G GLYCOSYLATION
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. urn:nbn:hr:217:090828
Mijakovac, Anika
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Mijakovac, A. (2023). CELL LINES WITH INTEGRATED CRISPRa AND CRISPRi SYSTEM AND THEIR APPLICATION IN ANALYSIS OF IMMUNOGLOBULIN G GLYCOSYLATION (Disertacija). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:090828

Mijakovac, Anika. "CELL LINES WITH INTEGRATED CRISPRa AND CRISPRi SYSTEM AND THEIR APPLICATION IN ANALYSIS OF IMMUNOGLOBULIN G GLYCOSYLATION." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:090828

Mijakovac, Anika. "CELL LINES WITH INTEGRATED CRISPRa AND CRISPRi SYSTEM AND THEIR APPLICATION IN ANALYSIS OF IMMUNOGLOBULIN G GLYCOSYLATION." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:090828

Mijakovac, A. (2023). 'CELL LINES WITH INTEGRATED CRISPRa AND CRISPRi SYSTEM AND THEIR APPLICATION IN ANALYSIS OF IMMUNOGLOBULIN G GLYCOSYLATION', Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 25.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:090828

Mijakovac A. CELL LINES WITH INTEGRATED CRISPRa AND CRISPRi SYSTEM AND THEIR APPLICATION IN ANALYSIS OF IMMUNOGLOBULIN G GLYCOSYLATION [Disertacija]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2023 [pristupljeno 25.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:090828

A. Mijakovac, "CELL LINES WITH INTEGRATED CRISPRa AND CRISPRi SYSTEM AND THEIR APPLICATION IN ANALYSIS OF IMMUNOGLOBULIN G GLYCOSYLATION", Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2023. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:090828

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:090828
Podaci o radu
NaslovCELL LINES WITH INTEGRATED CRISPRa AND CRISPRi SYSTEM AND THEIR APPLICATION IN ANALYSIS OF IMMUNOGLOBULIN G GLYCOSYLATION
Naslov (hrvatski)STANIČNE LINIJE S INTEGRIRANIM CRISPRa I CRISPRi SUSTAVOM I NJIHOVA PRIMJENA U ANALIZI GLIKOZILACIJE IMUNOGLOBULINA G
AutorAnika Mijakovac
MentorAleksandar Vojta (mentor)
Član povjerenstvaVlatka Zoldoš (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaIvana Ivančić Baće (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2023-03-20, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		577 - Biokemija. Molekularna biologija. Biofizika
Sažetak
Mechanisms regulating immunoglobulin G (IgG) glycosylation are largely unknown. To perform functional validation of genes implicated in IgG glycosylation we developed the HEK293-F system. Utilizing transposons, we integrated dCas9-VPR/dCas9-KRAB expression cassettes in the genome of FreeStyle™ 293-F cells for targeted manipulation (CRISPRa/CRISPRi) of selected genes. Transfection of HEK293-F cells with IgG-gRNAbearing plasmid enabled simultaneous analysis of gene expression and IgG glycome. Utilizing this system, we validated the role of the SPPL3 locus in IgG sialylation. Activation of estrogenregulated genes, RUNX3 and SPINK4, decreased the galactosylated IgG glycoforms, a phenotype characteristic of menopause and aging. To further examine the magnitude of genetic influences on IgG glycosylation in aging we performed a heritability analysis on the glycan clock marker of biological age. Heritability of the glycan clock, when corrected for the age of the individuals, proved to be high (~71%). This served to demonstrate the necessity to develop new technologies able to dissect the observed genetic factors regulating IgG glycosylation associated not only with disease but also with aging.
Sažetak (hrvatski)
Regulatorni mehanizmi glikozilacije imunoglobulina G (IgG) većinom su nepoznati. Kako bismo proveli funkcionalnu potvrdu uloge gena asociranih s IgG glikozilacijom razvili smo sustav HEK293-F. Korištenjem transpozona, ugradili smo kazete dCas9-VPR/dCas9-KRAB u genom stanica FreeStyle™ 293-F za ciljanu manipulaciju (CRISPRa/CRISPRi) odabranih gena. Transfekcija stanica HEK293-F s plazmidom IgG-gRNA omogućila nam je istovremenu analizu ekspresije gena i IgG glikoma. Korištenjem ovog sustava potvrdili smo ulogu lokusa SPPL3 u IgG sijalinizaciji. Aktiviranjem gena reguliranih estrogenom, RUNX3 i SPINK4, došlo je do smanjenja galaktoziliranih IgG glikoformi odnosno pojave fenotipa karakterističnog za menopauzu i starenje. Kako bismo dodatno istražili opseg genetičkih utjecaja na IgG glikozilaciju tijekom starenja, proveli smo analizu nasljednosti markera biološke dobi – glikanskog sata. Nasljednost glikanskog sata se pokazala visokom nakon korekcije za dob sudionika (~71%) čime smo pokazali kako je neophodno razvijati nove tehnologije koje će razjasniti genetičke faktore uključene u regulaciju glikozilacije IgG-a, povezane ne samo s bolestima već i sa starenjem.
Ključne riječi
Ključne riječi (hrvatski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:090828
Datum promocije2023
Studijski programNaziv: Biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: poslijediplomski doktorski
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2023-04-03 09:33:13