prikaz prve stranice dokumenta Računalna analiza interakcija kvercetina i epigalokatehin-3-galata te njihovih metabolita sa serumskim albuminima
  Preuzmi
PDF 4.43 MB
diplomski rad
Računalna analiza interakcija kvercetina i epigalokatehin-3-galata te njihovih metabolita sa serumskim albuminima
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2016. urn:nbn:hr:217:409118
Matić, Sara
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Matić, S. (2016). Računalna analiza interakcija kvercetina i epigalokatehin-3-galata te njihovih metabolita sa serumskim albuminima (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:409118

Matić, Sara. "Računalna analiza interakcija kvercetina i epigalokatehin-3-galata te njihovih metabolita sa serumskim albuminima." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:409118

Matić, Sara. "Računalna analiza interakcija kvercetina i epigalokatehin-3-galata te njihovih metabolita sa serumskim albuminima." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:409118

Matić, S. (2016). 'Računalna analiza interakcija kvercetina i epigalokatehin-3-galata te njihovih metabolita sa serumskim albuminima', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 31.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:409118

Matić S. Računalna analiza interakcija kvercetina i epigalokatehin-3-galata te njihovih metabolita sa serumskim albuminima [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2016 [pristupljeno 31.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:409118

S. Matić, "Računalna analiza interakcija kvercetina i epigalokatehin-3-galata te njihovih metabolita sa serumskim albuminima", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2016. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:409118

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:409118
Podaci o radu
NaslovRačunalna analiza interakcija kvercetina i epigalokatehin-3-galata te njihovih metabolita sa serumskim albuminima
Naslov (engleski)In silico analysis of interactions of quercetin and epigallocatechin-gallate (EGCG) as well as their metabolites with serum albumins
AutorSara Matić
MentorSanja Tomić (mentor)
MentorBiljana Balen (mentor)
Član povjerenstvaBiljana Balen (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaŽeljka Vidaković-Cifrek (član povjerenstva)
Član povjerenstvaVesna Benković (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIvana Ivančić Baće (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2016-06-29, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Polifenoli su aromatski sekundarni biljni metaboliti, za koje postoje brojni dokazi o povoljnom učinku na ljudsko zdravlje. Antioksidativne, antikancerogene i mnoge druge opažene aktivnosti polifenola ovise o njihovoj bioraspoloživosti. Budući da su polifenoli prisutni u plazmi metabolički modificirani, analizom glavnih komponenti uspoređen je utjecaj metilacije, sulfatacije i glukuronidacije te deprotonacije i dvostruke oksidacije na farmakokinetička svojstva kvercetina i katehina zelenog čaja. Ovi polifenoli se u plazmi vežu na serumski albumin, najzastupljeniji protein plazme, čija je najvažnija funkcija reverzibilno vezanje i transport velikog broja endogenih i egzogenih molekula. Utjecaj metaboličkih modifikacija na način i afinitet vezanja kvercetina i katehina u Sudlovljevo vezno mjesto 1 istražen je molekulskim uklapanjem u ljudski i goveđi serumski albumin pomoću programa AutoDock. Dobiveni rezultati su u skladu s dostupnim eksperimentalnim podacima iz literature. Sulfatacija se općenito pokazala najpovoljnijom modifikacijoma za vezanje ovih polifenola na oba albumina i mogla bi biti uzrokom kompeticije polifenola s lijekovima za vezanje na albumin u plazmi. Rezultati dobiveni za ljudski i goveđi albumin su međusobno značajno različiti što ukazuje da goveđi albumin nije povoljan analog humanom za istraživanje vezanja polifenola na serumski albumin. Također je deteljno ispitan utjecaj početnih struktura i parcijalnih atomskih naboja na rezultate molekulskog uklapanja AutoDockom.
Sažetak (engleski)
Polyphenols are aromatic secondary plant metabolites, with numerous evidences for human health benefit. Antioxidative, anticancer and other activities of polyphenols depend on their free plasma concentration. Since polyphenols present in plasma are usually metabolically modified, the principle component analysis was used to study effects of methylation, sulfation and glucuronidation, as well as deprotonation and double oxidation, on pharmacokinetic properties of quercetin and green tea catechins. In plasma, these polyphenols bind to serum albumin, the most abundant plasma protein which reversibly binds various endogenous and exogenous compounds. In order to determine the effects of metabolic modifications of polyphenols on binding pose and affinity for Sudlow binding site 1, molecular docking was performed in human and bovine serum albumin using AutoDock. The results agree with available experimental data. Sulfation was shown to be the most favourable modification for binding of polyphenols to both albumins, and may be responsible for competition with drugs for binding to albumin. The results obtained for HSA and BSA were significantly different, pointing out that bovine albumin is not a suitable replacement for human analogue in affinity studies. Furthermore, effects of initial structures and partial atomic charges on the results of molecular docking with AutoDock have been studied.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:409118
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2017-05-08 10:56:08