prikaz prve stranice dokumenta Utjecaj temperature i proteina StpA na transkript gena antiCas u zaštiti bakterija Escherichia coli sustavom CRISPR-Cas
  Preuzmi
PDF 1.27 MB
diplomski rad
Utjecaj temperature i proteina StpA na transkript gena antiCas u zaštiti bakterija Escherichia coli sustavom CRISPR-Cas
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. urn:nbn:hr:217:307365
Knežević, Tea
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Knežević, T. (2023). Utjecaj temperature i proteina StpA na transkript gena antiCas u zaštiti bakterija Escherichia coli sustavom CRISPR-Cas (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:307365

Knežević, Tea. "Utjecaj temperature i proteina StpA na transkript gena antiCas u zaštiti bakterija Escherichia coli sustavom CRISPR-Cas." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:307365

Knežević, Tea. "Utjecaj temperature i proteina StpA na transkript gena antiCas u zaštiti bakterija Escherichia coli sustavom CRISPR-Cas." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:307365

Knežević, T. (2023). 'Utjecaj temperature i proteina StpA na transkript gena antiCas u zaštiti bakterija Escherichia coli sustavom CRISPR-Cas', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 25.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:307365

Knežević T. Utjecaj temperature i proteina StpA na transkript gena antiCas u zaštiti bakterija Escherichia coli sustavom CRISPR-Cas [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2023 [pristupljeno 25.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:307365

T. Knežević, "Utjecaj temperature i proteina StpA na transkript gena antiCas u zaštiti bakterija Escherichia coli sustavom CRISPR-Cas", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2023. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:307365

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:307365
Podaci o radu
NaslovUtjecaj temperature i proteina StpA na transkript gena antiCas u zaštiti bakterija Escherichia coli sustavom CRISPR-Cas
Naslov (engleski)The effect of the temperature and StpA protein on the antiCas transcript in the CRISPR-Cas mediated protection of Escherichia coli
AutorTea Knežević
MentorIvana Ivančić Baće (mentor)
Član povjerenstvaIvana Ivančić Baće (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMirela Sertić Perić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaNenad Judaš (član povjerenstva)
Član povjerenstvaŽeljka Soldin (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2023-09-22, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Mnoge bakterije i većina arheja koriste funkcionalne sustave CRISPR-Cas u obrani protiv strane invazivne DNA. Ekspresija komponenata sustava CRISPR-Cas u E. coli regulirana je s četiri promotora i moguća je samo ako je transkripcijski represor H-NS inaktiviran (Δhns). S promotora anti-Pcas se prepisuje transkript gena antiCas koji nepoznatim mehanizmom utječe na aktivnost sustava CRISPR-Cas. Paralog proteina H-NS, protein StpA u suvišku ukida otpornost na infekciju λvir fagom u Δhns stanicama na 30℃ tako što se ponaša kao dodatni represor. U ovom radu istražena je mogućnost da protein StpA svojom ulogom RNA šaperona utječe na tercijarnu strukturu transkripta antiCas u ovisnosti o temperaturi i time na nukleaznu aktivnost proteina Cas3. Praćenjem otpornosti stanica na infekciju fagom λvir utvrđeno je da suvišak transkripta antiCas pri 31°C inhibira aktivnost CRISPR-Cas sustava neovisno o proteinu StpA, dok je pri suvišku proteina Cas3 na 37°C potreban RNA šaperon StpA kako bi očuvao negativni učinak. Povećana ekspresija transkripta antiCas u mutantima s inducibilnim genima cas uzrokuje lizu stanica i na 31°C i 37°C.
Sažetak (engleski)
Many bacteria and most archaea use functional CRISPR-Cas systems in defense against invading DNA. The expression of CRISPR-Cas system components in E. coli is regulated by four promoters and is only possible if the transcriptional repressor H-NS is inactivated (Δhns). The antiCas gene transcript is transcribed from the anti-Pcas promoter, which affects the activity of the CRISPR-Cas system by an unknown mechanism. A paralog of H-NS protein, StpA protein in excess abolish resistance to λvir phage infection in Δhns cells at 30℃ by acting as an additional repressor. In this paper it was investigated whether the protein StpA, with its role as an RNA chaperone, affects the tertiary structure of the antiCas transcript in temperature dependent manner and consequently affects the nuclease activity of the Cas3 protein. By monitoring the resistance to phage λvir infection, it was determined that the excess of antiCas transcript at 31°C inhibits the activity of the CRISPR-Cas system independently of the StpA protein, while the excess of the Cas3 protein at 37°C requires RNA chaperone StpA to preserve the negative effect. Increased expression of antiCas transcripts in mutants with inducible genes cas causes cell lysis at both 31°C and 37°C.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:307365
Studijski programNaziv: Biologija i kemija; smjerovi: nastavnički
Smjer: nastavnički
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: integrirani preddiplomski i diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra edukacije biologije i kemije (mag. educ. biol. et chem.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2024-09-22
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2023-10-25 08:55:18