prikaz prve stranice dokumenta The repair of Topoisomerase 1 and 2 DNA-protein crosslinks in vivo
  Preuzmi
PDF 11.57 MB
doktorski rad
The repair of Topoisomerase 1 and 2 DNA-protein crosslinks in vivo
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. urn:nbn:hr:217:039955
Antičević, Ivan
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Antičević, I. (2023). The repair of Topoisomerase 1 and 2 DNA-protein crosslinks in vivo (Doktorski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:039955

Antičević, Ivan. "The repair of Topoisomerase 1 and 2 DNA-protein crosslinks in vivo." Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:039955

Antičević, Ivan. "The repair of Topoisomerase 1 and 2 DNA-protein crosslinks in vivo." Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:039955

Antičević, I. (2023). 'The repair of Topoisomerase 1 and 2 DNA-protein crosslinks in vivo', Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 23.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:039955

Antičević I. The repair of Topoisomerase 1 and 2 DNA-protein crosslinks in vivo [Doktorski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2023 [pristupljeno 23.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:039955

I. Antičević, "The repair of Topoisomerase 1 and 2 DNA-protein crosslinks in vivo", Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2023. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:039955

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:039955
Podaci o radu
NaslovThe repair of Topoisomerase 1 and 2 DNA-protein crosslinks in vivo
Naslov (hrvatski)Popravak križnih veza između DNA i topoizomeraza 1 i 2
AutorIvan Antičević
MentorMarta Popović (mentor)
Član povjerenstvaTvrtko Smital (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDragomira Majhen (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMarko Močibob (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2023-11-17, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		577 - Biokemija. Molekularna biologija. Biofizika
Sažetak
DNA-protein crosslinks (DPCs) are frequent and damaging DNA lesions that affect all DNA transactions, which can lead to the formation of DSBs (double-strand DNA breaks), genomic instability and cell death. At the organismal level, impaired DPC repair (DPCR) is associated with cancer, aging, and neurodegeneration. Repair of the two most abundant enzymatic DPCs, involving topoisomerase 1 and 2 was studied in cell models, but data from organisms are still limited. Here, using a zebrafish model and human cells, we show that endogenous TOP1-DPCs are repaired by TDP1 and SPRTN through independent pathways. Notably, chemically induced TOP1-DPCs, using camptothecin or formaldehyde, require an epistatic action of both enzymes, and effectively prevent the accumulation of TOP1-DPC-related damage. Furthermore, we identified the zebrafish Tdp2 orthologue, Tdp2b, as the enzyme responsible for the removal of Top2-DPC residues. Reduced Tdp2 function, observed in both, living organisms and cellular models, causes significant phenotypic changes. This study provides the first insights into the repair of TOP1- and TOP2-DPCs in vivo.
Sažetak (hrvatski)
Križne veze proteina i DNA (eng. DPCs) su česte i štetne lezije DNA koje ometaju sve procese na DNA, što može dovesti do pojave dvostrukih lomova, genomske nestabilnosti i stanične smrti. Na razini organizma, neefikasan popravak križnih veza proteina i DNA povezan je s nastankom tumora, starenjem i neurodegeneracijom. Dok je popravak najčešćih enzimskih DPC-a, Topoizomeraze 1 i 2, pručavan u staničnim modelima, podaci o ovom popravku u organizmima još uvijek su nedostatni. U ovom istraživanju, koristeći model ribe zebrice i ljudske stanične kulture , pokazali smo in vivo da se endogeni popravak TOP1-DPC odvija putem enzima TDP1 i SPRTN, pri čemu ti enzimi djeluju neovisno jedan o drugome. Nadalje, DPC-evi s TOP1 inducirani kemijski, korištenjem kamptotecina ili formaldehida, zahtijevaju međusobno ovisno djelovanje oba enzima kako bi se učinkovito spriječilo nakupljanje oštećenja povezanih s TOP1-DPC-ovima. U ovom radu, pokazali smo kako je zebričin Tdp2 ortolog, Tdp2b, enzim odgovoran za uklanjanje ostataka Top2-DPC-a s DNA. Smanjenje aktivnosti Tdp2, kako u živim organizmima tako i u staničnim modelima, rezultira značajnim fenotipskim promjenama. Ovo istraživanje pruža prve uvide u mehanizme popravka TOP1- i TOP2-DPC-eva in vivo.
Ključne riječi
Ključne riječi (hrvatski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:039955
Datum promocije2023
ProjektŠifra: UIP-05-2017
Naziv: Metode za interpretaciju medicinskih snimki za detaljnu analizu zdravlja srca
Naziv: Medical Image Interpretation Methods for a Detailed Heart Health Analysis
Voditelj: Irena Galić
Pravna nadležnost: Hrvatska
Financijer: HRZZ
Linija financiranja: Nema
Studijski programNaziv: Biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: doktorski studij
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti u području prirodnih znanosti (dr. sc. natur.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2024-11-17
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2023-11-29 12:15:35