prikaz prve stranice dokumenta Utjecaj točkastih mutacija u genu antiCas i proteina HtpG na aktivnost sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli
Rad dostupan nakon 2025-02-23
diplomski rad
Utjecaj točkastih mutacija u genu antiCas i proteina HtpG na aktivnost sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. urn:nbn:hr:217:763009
Žagar, Mirta
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Žagar, M. (2024). Utjecaj točkastih mutacija u genu antiCas i proteina HtpG na aktivnost sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:763009

Žagar, Mirta. "Utjecaj točkastih mutacija u genu antiCas i proteina HtpG na aktivnost sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:763009

Žagar, Mirta. "Utjecaj točkastih mutacija u genu antiCas i proteina HtpG na aktivnost sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:763009

Žagar, M. (2024). 'Utjecaj točkastih mutacija u genu antiCas i proteina HtpG na aktivnost sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 22.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:763009

Žagar M. Utjecaj točkastih mutacija u genu antiCas i proteina HtpG na aktivnost sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2024 [pristupljeno 22.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:763009

M. Žagar, "Utjecaj točkastih mutacija u genu antiCas i proteina HtpG na aktivnost sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2024. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:763009

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:763009
Podaci o radu
NaslovUtjecaj točkastih mutacija u genu antiCas i proteina HtpG na aktivnost sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli
Naslov (engleski)The effects of point mutations in the antiCas gene and the HtpG protein on CRISPR-Cas system activity in Escherichia coli
AutorMirta Žagar
MentorIvana Ivančić Baće (mentor)
Član povjerenstvaIvana Ivančić Baće (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaTomislav Ivanković (član povjerenstva)
Član povjerenstvaNenad Malenica (član povjerenstva)
Član povjerenstvaPetra Peharec Štefanić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2024-02-23, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Sustav CRISPR-Cas je prokariotski adaptivni obrambeni mehanizam protiv stranih genetičkih elemenata kao što su plazmidi i bakteriofagi. Ovaj sustav sastoji se od lokusa CRISPR koji sadrži segmente strane DNA (razmaknice) okružene palindromskim ponavljanjima te pridruženih gena cas koji sudjeluju u svim fazama obrane. Regulacija sustava CRISPR-Cas je kompleksna i nije još u potpunosti razjašnjena, a najviše je istražena u bakteriji Escherichia coli soja K-12. Neki od poznatih regulatora sustava CRISPR-Cas u bakteriji E. coli su šaperon HtpG, transkript antiCas i temperatura. U ovom radu istražen je utjecaj transkripta antiCas i njegovih točkastih mutanata u obrani bakterija od infekcije fagom λvir kada su nadeksprimirani s plazmida na 31°C. Osim toga, istražen je utjecaj nedostatka transkripta antiCas na aktivnost sustava CRISPR-Cas pri infekciji bakterija fagima na temperaturama od 31°C, 34,5°C te 37°C. Dobiveni rezultati ukazuju na negativan utjecaj transkripta antiCas i njegovih mutanata na aktivnost sustava CRISPR-Cas samo kad su eksprimirani u suvišku. Nadalje, pokazano je da transkript antiCas nema utjecaj na temperaturno ovisnu imunost bakterija na infekciju fagima, već da ona ovisi jedino o pomaku aminokiseline Trp-406 u proteinu Cas3.
Sažetak (engleski)
The CRISPR-Cas system is a prokaryotic adaptive defense mechanism against foreign genetic elements such as plasmids and bacteriophages. This system consists of a CRISPR locus containing fragments of foreign DNA (spacers) surrounded by palindromic repeats, and the associated cas genes involved in all phases of defense. The regulation of the CRISPR-Cas system is very complex and not yet fully understood, and it has mainly been studied in the Escherichia coli strain K-12. Some of the known regulators of the CRISPR-Cas system in E. coli are the chaperone HtpG, the antiCas transcript, and temperature. In this study, the influence of the overexpression of the antiCas transcript and its point mutants from the plasmid on the defense of bacteria against λvir infection at 31°C was investigated. Also, the effect of the lack of the antiCas transcript on the activity of the CRISPR-Cas system against phage infection was investigated at temperatures of 31°C, 34.5°C, and 37°C. The obtained results indicate that the antiCas transcript and its mutants have a negative role on the activity of the CRISPR-Cas system only when they are overexpressed. Furthermore, it was shown that the antiCas transcript has no effect on the temperature-dependent immunity of the bacteria against phage infection, but that this depends only on the shift of the amino acid Trp-406 in the Cas3 protein.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:763009
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a magistar/magistra molekularne biologije (univ. mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaRad dostupan nakon
Datum isteka embarga: 2025-02-23
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2024-03-06 11:11:55