prikaz prve stranice dokumenta Uloga aminoacil-tRNA-sintetaza u staničnom odgovoru na oksidacijski stres
Rad dostupan nakon 2026-03-07
doktorski rad
Uloga aminoacil-tRNA-sintetaza u staničnom odgovoru na oksidacijski stres
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. urn:nbn:hr:217:345036
Ević, Valentina
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Kemijski odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Ević, V. (2024). Uloga aminoacil-tRNA-sintetaza u staničnom odgovoru na oksidacijski stres (Doktorski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:345036

Ević, Valentina. "Uloga aminoacil-tRNA-sintetaza u staničnom odgovoru na oksidacijski stres." Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:345036

Ević, Valentina. "Uloga aminoacil-tRNA-sintetaza u staničnom odgovoru na oksidacijski stres." Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:345036

Ević, V. (2024). 'Uloga aminoacil-tRNA-sintetaza u staničnom odgovoru na oksidacijski stres', Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 16.07.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:345036

Ević V. Uloga aminoacil-tRNA-sintetaza u staničnom odgovoru na oksidacijski stres [Doktorski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2024 [pristupljeno 16.07.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:345036

V. Ević, "Uloga aminoacil-tRNA-sintetaza u staničnom odgovoru na oksidacijski stres", Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2024. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:345036

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:345036
Podaci o radu
NaslovUloga aminoacil-tRNA-sintetaza u staničnom odgovoru na oksidacijski stres
Naslov (engleski)The role of aminoacyl-tRNA synthetases in cellular oxidative stress response
AutorValentina Ević
MentorJasmina Rokov Plavec (mentor)
Član povjerenstvaIvana Ivančić Baće (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaIvana Leščić Ašler (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMorana Dulić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Kemijski odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2024-03-07, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Kemija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		54 - Kemija. Kristalografija. Mineralogija
Sažetak
Aminoacil-tRNA-sintetaze (AARS) su enzimi koji kataliziraju nastanak kovalentne veze između pripadne aminokiseline i tRNA pri čemu nastaje aminoacil-tRNA, supstrat u procesu translacije. Citosolne AARS zbog redukcijskog okoliša inače nemaju disulfidnu vezu, no pronađena je u kristalnoj strukturi citosolne seril-tRNA-sintetaze (SerRS) iz biljke Arabidopsis thaliana. U ovom radu dizajnirane su jednostruko (SerRS_C213S, SerRS_C244S) i dvostruko mutirane inačice (SerRS_C213S/C244S) i pokazano je da dolazi do reverzibilnog nastajanja disulfidne veze što omogućuje enzimu nepromijenjenu aktivnost u oksidacijskom stresu. Također je istražen utjecaj mistranslacije uzrokovane ugradnjom valina (Val) ili norvalina (Nva) umjesto izoleucina na odgovor na oksidacijski stres. U tu svrhu korišteni su sojevi bakterije Escherichia coli koji eksprimiraju izoleucil-tRNA-sintetazu s inaktiviranom domenom za popravak pogreške (PS7066 i ED-). Rezultati su pokazali da prethodni uzgoj stanica u mistranslatirajućim uvjetima do stacionarne faze uzrokuje bolje preživljenje i rast u oksidacijskom stresu u odnosu na stanice koje nisu rasle u mistranslatirajućim uvjetima. Nadalje, uočeno je da uzgoj stanica s inaktiviranim RpoS-om u mediju s višim koncentracijama valina ili norvalina izaziva adaptaciju na oksidacijski stres koja je neovisna o RpoS-u, dok stanice uzgojene pri nižim koncentracijama valina ili norvalina ne preživljavaju u uvjetima oksidacijskog stresa.
Sažetak (engleski)
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARS) are enzymes that catalyze covalent bond formation between cognate amino acid and tRNA to produce aminoacyl-tRNA - substrate in the translation process. Due to the reductive environment, cytosolic AARSs do not have disulfide bonds, however, one was found in the crystal structure of cytosolic seryl-tRNA synthetase (SerRS) from the plant Arabidopsis thaliana. In this study, point (SerRS_C213S, SerRS_C244S) and double mutants (SerRS_C213S/C244S) were designed and it was shown that the reversible disulfide bond formation allows unchanged enzyme activity under oxidative stress. Also, the effect of isoleucine-to-valine (Val) or norvaline (Nva) mistranslation on oxidative stress response was investigated. For this purpose, Escherichia coli strains expressing isoleucyl-tRNA synthetase with a mutation in the editing domain were used (PS7066 and ED-). The results show that prior cell growth in mistranslating conditions to stationary phase leads to higher survival and growth rates under oxidative stress compared to cells that were not grown in mistranslating conditions. Furthermore, it was shown that prior growth of cells with inactivated RpoS in media with higher concentrations of Val or Nva leads to adaptation to oxidative stress that is RpoS- independent, while the cells grown with lower concentrations of Val or Nva do not survive in oxidative stress conditions.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:345036
Datum promocije2024
ProjektŠifra: IP-2016-06-6272
Naziv: Aminoacil-tRNA-sintetaze kao čuvari standardnog genetičkog koda
Naziv: Aminoacyl-tRNA synthetases as gatekeepers of the standard genetic code
Kratica: AARSCODE
Voditelj: Ita Gruić-Sovulj
Pravna nadležnost: Hrvatska
Financijer: Hrvatska zaklada za znanost
Linija financiranja: Research Projects
ProjektŠifra: DOK-2018-09-1578
Naziv: Projekt razvoja karijera mladih istraživača - izobrazba novih doktora znanosti, mentor: J. Rokov Plavec
Naziv: Young Researchers’ Career Development Project - training new doctoral students, mentor: J. Rokov Plavec
Kratica: DOK-2018-09-Rokov Plavec
Voditelj: Jasmina Rokov Plavec
Pravna nadležnost: Hrvatska
Financijer: Hrvatska zaklada za znanost
Linija financiranja: Young Researchers’ Career Development Project - Training New Doctoral Students
Studijski programNaziv: Kemija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: doktorski studij
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica u području prirodnih znanosti (dr. sc. natur.)
Vrsta resursaTekst
Opseg130, XXXIII str. ; 30 cm
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaRad dostupan nakon
Datum isteka embarga: 2026-03-07
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2024-03-11 12:23:39